鸽副粘病毒亚基因型广泛分布对免疫缺陷人群构成健康风险

这篇综述揭示了鸽副粘病毒1型(PPMV-1)作为禽正粘病毒1型(AOAV-1)的变异株，其亚基因型VI.2.1.1.2.2在全球范围内的传播趋势。研究通过系统发育分析证实，该亚型与2003年以来多国免疫缺陷患者致死性感染病例相关，强调需加强公共卫生监测。

　　

ABSTRACT

鸽副粘病毒1型(PPMV-1)是新城疫病毒(AOAV-1)的抗原变异株，在全球鸽类和鸠类中引起致死性感染。虽然AOAV-1通常仅导致人类轻微自限性结膜炎，但自2003年起，PPMV-1在荷兰、美国、法国、中国和澳大利亚的免疫缺陷人群中引发了严重的呼吸道和神经系统感染。

Introduction

新城疫(ND)是由禽正粘病毒1型(AOAV-1)引起的禽类疾病。该病毒为单股负链RNA病毒，基因组约15.19kb，编码6种结构蛋白。根据F蛋白裂解位点氨基酸基序，可分为弱毒( lentogenic )、中等毒力( mesogenic )和强毒( velogenic )株。人类感染通常通过接触高病毒载量的禽类或其制品，症状多为结膜炎，罕见人传人现象。

Methods

2012-2024年间从南非自由活动的鸽类和鸠类中分离PPMV-1毒株，采用常规和二代测序技术进行测序。通过最大似然法和时间尺度系统发育分析，结合人类AOAV-1感染病例回顾，对未分类毒株进行重新鉴定。

Results

研究发现：

1. 1.

   亚基因型VI.2.1.1.2.1自2005年起在南非持续流行

2. 2.

   广泛分布于欧洲、亚洲和澳大利亚的VI.2.1.1.2.2亚型于2017年9月(95% HPD 2016年1月-2019年6月)传入南非

3. 3.

   荷兰(2003年)、美国(2007年)和法国(2021年)致死性人类感染病例分别由VI.2.1.1.2.2、VI.2.1.1.1和XXI.1.1亚型引起

Conclusions

关键结论包括：

1. 1.

   1953年以来记录的5例AOAV-1相关人类死亡均由PPMV-1引起

2. 2.

   其中3例死亡和1例重症存活病例与VI.2.1.1.2.2亚型相关

3. 3.

   鸽类和鸠类广泛携带的PPMV-1对免疫缺陷人群构成重大健康风险

1 Introduction

AOAV-1根据F基因分为Class I和Class II两大基因群。PPMV-1特指与鸽类感染相关的抗原变异株，在未免疫鸽群中表现为高致死率。最新分类系统将PPMV-1分为基因型VI(含7个亚型)和XXI(含4个亚型)。

2 Materials and Methods

2.1 采样与病毒分离

2012-2024年间收集南非各地死亡鸽类和鸠类样本，通过鸡胚接种分离病毒，采用TRIzol或自动化系统提取核酸。

2.2 RT-PCR与Sanger测序

采用靶向L基因的实时定量RT-PCR(qRT-PCR)检测AOAV-1，扩增包含F₀裂解位点的F-M基因间区片段进行测序。

2.3 离子 torrent测序与基因组组装

使用Complete Whole Transcriptome Amplification Kit制备转录组文库，通过参考序列比对和de novo组装相结合的方法完成基因组组装。

2.4 系统发育与tMRCA分析

采用MAFFT进行多序列比对，IQ Tree构建最大似然树。对VI.2.1.1.2.2亚型进行贝叶斯天际线模型分析，估算最近共同祖先时间。

3 Results

研究发现南非流行的PPMV-1包含：

1. 1.

   长期存在的VI.2.1.1.2.1亚型

2. 2.

   新传入的VI.2.1.1.2.2亚型

   所有毒株F蛋白裂解位点均含RRQKRF基序，符合强毒株特征。

人类病例分析显示：

1. 1.

   2003年荷兰病例为VI.2.1.1.2.2亚型

2. 2.

   2007年美国病例为VI.2.1.1.1亚型

3. 3.

   2021年法国病例为XXI.1.1亚型

4 Discussion

南非家禽业曾受基因型VIII和VII AOAV-1影响，2015年后强毒株感染仅限于鸽类。值得注意的是：

1. 1.

   VI.2.1.1.2.2亚型与4例严重人类感染相关(3例死亡)

2. 2.

   所有死亡病例均发生在免疫缺陷个体

3. 3.

   南非HIV感染者众多(约780万)，增加公共卫生风险

研究强调：

1. 1.

   需提高对AOAV-1人畜共患潜力的认识

2. 2.

   对不明原因呼吸道病例应考虑PPMV-1感染可能

3. 3.

   需深入研究PPMV-1获得人类致病性的机制