马达加斯加重引入阿尔达布拉象龟的遗传保护：种群起源、繁殖贡献与长期生存力研究

这篇综述通过29个微卫星位点（SSR）分析了阿尔达布拉象龟（Aldabrachelys gigantea）重引入种群的遗传多样性，揭示了12只奠基个体源自阿尔达布拉环礁南部（GTS/GTE遗传群），并通过父系分析发现繁殖贡献高度偏倚（单一雄性#6主导）。研究提出通过跨岛个体交换构建人工集合种群（metapopulation），以维持MHC（主要组织相容性复合体）区域多样性，避免近交衰退（inbreeding depression），为巨型龟类的生态替代（ecological replacement）提供关键遗传管理策略。

　　

阿尔达布拉象龟的遗传保护背景

作为马达加斯加已灭绝巨型陆龟（A. abrupta）的现存近亲，阿尔达布拉象龟是印度洋岛屿生态修复的关键物种。2018年，12只来源不明的个体被引入安贾贾维保护区（Anjajavy Reserve），标志着该物种在消失600年后重返原生地。研究团队通过新开发的17个微卫星位点（含5个MHC关联位点）和12个跨物种转移位点，首次系统评估了该种群的遗传代表性与繁殖动态。

种群遗传结构与起源解析

基于32只阿尔达布拉原生个体和15只马达加斯加个体的聚类分析（STRUCTURE），揭示环礁存在两大遗传群：东部大岛群（GTE）和南部大岛群（GTS），分化程度达3%-9%（F_ST）。奠基个体中，雌性#2/9/11属于GTS群，其余多属GTE群，表明其可能源自阿尔达布拉南部。VarEff模型显示该物种历史上经历多次种群波动，包括4.5万年前的物种分化事件和2万年前冰川期末期的瓶颈效应，但近代捕捞导致的瓶颈信号被长世代周期（约60年）稀释。

MHC区域的低重组率现象

染色体12上1.5 Mb的MHC区域（含9个免疫相关基因）在50只后代中呈现完全连锁（r_D=1），未检测到重组事件。定义的8种MHC单倍型（MHC_X）中， homozygous个体（如雄性#4/雌性#3）繁殖成功率显著降低，暗示MHC介导的配偶选择可能通过"相容基因假说"（compatible gene hypothesis）维持多样性。该区域重组率（<0.67 cM/Mb）远低于基因组平均水平（1.64-4.29 cM/Mb），可能与着丝粒邻近或表观调控有关。

繁殖偏倚与遗传管理建议

父系分析显示，50只后代中49只（98%）源自单一GTE群雄性#6与GTS群雌性的杂交，导致后代观察杂合度（H_O=0.46）显著高于预期（H_E=0.39；F_IS=-0.16*）。这种跨群交配虽提升短期多样性，但单一父系主导可能加剧未来近交风险。研究建议：（1）隔离雄性#6以促进其他雄性繁殖；（2）在印度洋各重引入点（如毛里求斯、罗德里格斯）间交换亚成体（10-15龄），构建人工集合种群；（3）优先选择MHC杂合个体进行移植。

生态修复的长期展望

作为体重超20 kg的唯一现存马达加斯加巨型草食动物，该种群的目标规模设定为2030年500只、2040年2000只，以恢复种子传播（seed dispersal）和火情调控（fire regime）等生态功能。研究强调，通过整合遗传管理（如平衡MHC单倍型频率）与行为观察（如交配偏好记录），可为全球生态替代项目提供范式。未来需持续监测选择压力下MHC区域的进化动态，以及低重组率对适应性潜力的影响。