西班牙东南部环境中单核细胞增生李斯特菌I系克隆的优势分布：从废水、反刍动物到自然生态系统的多环境追踪研究

这篇研究通过大规模纵向调查，揭示了单核细胞增生李斯特菌（L. monocytogenes）在废水、反刍动物农场、自然环境和食品加工环境中的分布规律。研究发现，高毒力I系菌株（82.9%）主导宿主相关环境（如废水和农场），而II系（74.1%）更适应食品加工环境。通过全基因组测序（WGS）和核心基因组多位点序列分型（cgMLST），研究者发现5%的菌株克隆类型（CTs）在不同环境间交叉传播，并鉴定出26个持久性克隆。该研究为理解李斯特菌生态适应性和防控提供了关键数据。

　　

引言

单核细胞增生李斯特菌（L. monocytogenes）是一种兼性胞内病原体，可引发人和动物的李斯特菌病，病死率高达18.1%。本研究通过多环境采样（废水、反刍动物农场、自然环境和食品加工厂）结合基因组学分析，揭示了其生态分布与进化特征。

材料与方法

研究历时4年（2019-2023年），采集了1490份环境样本和7395份食品加工样本。采用半弗雷泽和弗雷泽肉汤富集培养，通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）和WGS鉴定菌株。基因组分析基于Pasteur研究所的BIGSdb-Listeria平台，涵盖毒力岛（LIPI-1/3/4）、消毒剂抗性基因（bcrABC、emrC）等244个位点。

结果

1. 1.

   生态分布差异

   非致病性李斯特菌（如L. innocua）在自然环境中占比更高（3.3:1），而L. monocytogenes在宿主相关环境（废水和反刍动物粪便）中检出率显著更高（42.7% vs. 4.2%）。

2. 2.

   谱系分化

   高毒力I系（携带LIPI-3/4和完整inlA）在废水和农场中占82.9%，而II系（含inlA无义突变）主导食品加工环境（74.1%）。CC121（II系）在鱼类产品中占比高达60%，而CC9和ST213（I系）偏好肉类。

3. 3.

   跨环境传播

   cgMLST分析发现13个CTs在废水和食品厂间交叉检出，如L1-SL213-ST213-CT1846在肉类加工厂持续存在4年，提示环境-食品链传播风险。

4. 4.

   季节性规律

   食品加工环境中夏季检出率最高（p<0.05），而农场和废水中冬季更易检出，与人类病例季节分布一致。

讨论

研究揭示了I系菌株通过废水排放和反刍动物粪便进入自然环境的传播路径，而II系通过消毒剂抗性基因（如SSI-2）适应食品工业。持久性克隆（如CC121）的跨厂传播提示需加强环境监测。

结论

该研究为李斯特菌的"宿主-环境-食品"传播模型提供了基因组证据，建议针对不同谱系制定差异化防控策略，如对食品厂II系强化消毒，对农场I系加强粪便管理。