肥厚型心肌病枢纽基因与miRNA互作的多组学整合分析

研究人员通过整合多组学分析，揭示了肥厚型心肌病(HCM)中6个枢纽基因(IREB2、PTPN11、IQGAP1、PGM2、DIS3、GFPT1)和6个miRNAs(miR-124、miR-29b等)的调控网络。该研究通过GEO数据集挖掘、PPI网络分析和实验验证，发现这些基因在能量代谢和生长因子信号通路中发挥关键作用，为HCM诊断和治疗提供了新靶点。

　　

这项关于肥厚型心肌病(HCM)的多组学研究揭示了疾病发生的关键分子机制。研究人员通过分析GSE32453、GSE53408和GSE113439三个基因表达数据集，利用limma包筛选出1000个差异表达基因(DEGs)，并通过维恩分析鉴定出21个共同下调基因。

蛋白互作网络(PPI)和Cytoscape分析确定了6个核心枢纽基因：铁反应元件结合蛋白2(IREB2)、非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶11(PTPN11)、IQ基序包含GTP酶激活蛋白1(IQGAP1)、磷酸葡萄糖变位酶2(PGM2)、RNA外切酶DIS3以及谷氨酰胺-果糖-6-磷酸转氨酶1(GFPT1)。这些基因主要参与能量代谢和生长因子信号转导等细胞过程。

研究团队使用RT-qPCR和Western blot技术验证了这些基因在HCM患者中的表达模式。ROC曲线分析证实这些枢纽基因具有显著的诊断价值。此外，研究还发现6个上调的miRNAs(miR-124、miR-29b、miR-330、miR-34a、miR-375和miR-451)可能通过靶向调控这些枢纽基因参与HCM发病。

通过分子对接和药物预测分析，研究人员鉴定出多个可能靶向这些枢纽基因的潜在治疗化合物。这些发现为开发新型HCM诊断标志物和治疗策略提供了重要线索，特别是针对能量代谢异常和信号转导失调的治疗干预。