1950-1980年代虫媒病毒基因组特征解析：填补进化空白与评估新发传染病风险

【编辑推荐】本研究通过高通量测序技术对1950-1980年代发现的46种虫媒病毒（arboviruses）进行全基因组解析，涵盖8个病毒科的11个属，提出15个新病毒物种，发现Ossa病毒等重配事件，并基于基因组特征预测Lanjan等病毒的人类感染风险，为虫媒病毒（如Orbivirus、Orthobunyavirus）的进化、分类及新发传染病预警提供关键数据支撑。

　　

基因组技术揭开历史虫媒病毒的面纱

1950至1980年代发现的46种虫媒病毒（arboviruses）首次通过高通量测序获得近完整开放阅读框（ORF）序列。这些病毒分离自23个国家，跨越^{Sedoreoviridae}、^{Peribunyaviridae}等8个病毒科，其中56.5%为全新测序。研究不仅修正了Kununurra病毒等6个病毒的血清学误分类，还通过系统发育分析提出15个新物种，如Orbivirus属的Huacho病毒（VP3蛋白同源性仅62.6-64.4%）。

病毒家族的基因组密码

Reoviridae科的复杂结构：26个Orbivirus病毒呈现8-10节段双链RNA（dsRNA）基因组，其中Acado病毒等13种在节段9编码VP6/NS4双蛋白。而Ndelle病毒被重新归类为哺乳动物正呼肠病毒（MRV），其22,843 nt基因组与人类轻度胃肠炎相关。

Bunyavirales目的重配现象：Orthobunyavirus属的Ossa病毒M节段源自Madrid病毒，而Brus Laguna病毒则携带Alajuela病毒的M节段，揭示跨物种基因流动。

特殊案例：Lanjan病毒展现^{Phenuiviridae}科典型的双义编码策略，其S节段同时编码N/NSs蛋白，被提议为新Uukuvirus物种。

进化树上的新分支

Orbivirus的全球分布：Bauline病毒等7种与蜱传Great Island病毒群（Orbivirus magninsulae）聚类，可能威胁人类神经系统。D'Aguilar病毒则属于导致牛羊畸胎的Palyam病毒群（Orbivirus palyamense）。

人畜共患潜力：Porton's病毒（Hapavirus）和Cowbone Ridge病毒（Orthoflavivirus）分别分离自鸟类和蝙蝠，后者与无媒介的Modoc病毒亲缘最近。

基因组预测的警示灯

基于基因组组成模型评估显示：

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  极高风险：Lanjan病毒（得分0.52）可能通过蜱传播感染人类。

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  高风险集群：Zingilamo病毒（0.49）与Semliki森林病毒（SFV）同源，后者曾致实验室感染脑炎；Tindholmur病毒（0.47）与人类神经系统疾病相关Kemerovo病毒亲缘密切。

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  生态不确定性：尽管预测工具存在局限（未考虑宿主互作），80.8%的高风险病毒分离自蚊/蜱，凸显监测价值。

从测序到防控的桥梁

该研究填补了前基因组时代病毒数据的空白，为开发分子检测（如RT-PCR）奠定基础。正如寨卡病毒（ZIKV）的突然暴发所示，历史毒株的基因组解析或将成为应对未来新发传染病的"早期预警系统"。下一步需通过小鼠模型验证Bauline等病毒的致病性，并将基因组数据整合至全球虫媒病毒监测网络。