球型红杆菌AX7B全基因组测序揭示其作为脱落酸代谢菌株的分子机制

来自俄罗斯的研究人员针对植物激素脱落酸(ABA)微生物降解机制不清的科学问题，完成了豌豆根际分离的球型红杆菌AX7B全基因组测序。该菌株能以0.25 mg/mL ABA为唯一碳源，基因组含6.62 Mb染色体和0.44 Mb质粒，编码6,344个蛋白基因。研究为ABA降解通路解析及重金属植物修复应用奠定基础。

　　

在植物应激反应中起关键作用的脱落酸(ABA)，其微生物降解机制一直是学界认知的薄弱环节。科研团队从俄罗斯大诺夫哥罗德(57.148279°N, 31.179109°E)的豌豆根际分离出一株特殊菌株——能以ABA为唯一碳源的球型红杆菌(Rhodococcus globerulus)AX7B。

通过纳米孔测序技术(MinION R10)和Flye组装，研究者获得了6.62 Mb染色体与0.44 Mb质粒的完整基因组，GC含量达61.65%。引人注目的是，该基因组包含6,344个蛋白编码基因和70个RNA基因，其中15个rRNA、52个tRNA和3个ncRNA。

菌株鉴定过程充满波折：16S rRNA测序显示与球形诺卡氏菌(Nocardia globerula)相似度达99.79%，但平均核苷酸一致性(ANI)分析最终确认其属于球型红杆菌，与模式菌株NBRC 14531的ANI值为98.75%，数字化DNA-DNA杂交(dDDH)相似度达89.3%。

这项由俄罗斯科学基金会资助的研究，不仅揭示了ABA降解菌株的基因组特征，更为开发基于微生物的重金属污染修复技术提供了新思路。测序工作依托全俄农业微生物研究所核心设施完成，采用创新的建库方案——无需片段化的纳米孔原生条形码技术，获得平均读长达7,861 bp的高质量数据。