下一代治疗学革命:iPSCs联合基因组学、AI与“盘中临床试验”引领药物发现新范式

【字体: 时间:2025年09月09日 来源:Annual Review of Pharmacology and Toxicology 13.1

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  这篇综述系统阐述了iPSC(诱导多能干细胞)技术与人工智能(AI)如何重塑药物研发流程。通过解析FDA现代化法案2.0框架下的“盘中临床试验”(clinical trials in a dish)新范式,文章重点探讨了心血管疾病模型中iPSC衍生器官芯片、多组学分析(multiomics)与深度学习算法的协同应用,为降低92%的临床前研究失败率提供了突破性解决方案。

  

从传统到革新:iPSC与AI如何重构药物研发版图

药物开发的困境与转机

当前药物研发面临高达92%的临床失败率,主要归因于动物模型与人类生理的物种差异。FDA现代化法案2.0的颁布标志着范式转变——允许采用人类iPSC衍生模型替代部分动物试验。这种转变在心血管领域尤为迫切,30%的候选药物因未预见的心脏毒性(cardiotoxicity)而折戟,凸显传统模型的局限性。

iPSC技术:从细胞重编程到疾病建模

通过Yamanaka因子(OCT3/4/SOX2/KLF4/c-MYC)将体细胞重编程为iPSC,再分化为心肌细胞(iPSC-CMs),研究者成功构建了携带TTNLMNA等致病基因突变的心血管模型。例如LMNA突变模型再现了核膜异常、凋亡增加等病理特征,而CRISPR-Cas9基因编辑技术进一步实现了健康细胞系的快速致病突变引入。

三维革命:器官芯片与类器官的崛起

突破二维培养限制,心脏类器官(cardiac organoids)通过WNT/GSK3β通路调控形成自组织三维结构,模拟胎儿心脏跳动。斯坦福团队开发的缺氧响应性类器官甚至重现了心肌梗死后的钙紊乱和纤维化。更复杂的多器官微生理系统(MPS)整合了血管化心肌组织与肝模块,可同步评估药物代谢与心脏毒性。

AI驱动:从虚拟筛选到精准预测

深度学习算法在四个维度改变游戏规则:

  1. 1.

    图神经网络(GNN)分析分子结构预测ADMET(吸收/分布/代谢/排泄/毒性)特性

  2. 2.

    生成式AI设计新型化合物如SyntheMol生成的抗生素候选分子

  3. 3.

    卷积神经网络(CNN)自动解析心肌细胞形态学变化识别潜在心脏毒性药物

  4. 4.

    多组学数据整合建立个性化疗效预测模型,如NOTCH1突变内皮细胞的基因网络校正分析

盘中临床试验:个性化医疗的未来

“细胞村庄”(cell village)平台实现了千人规模iPSC并行药物测试,消除批次差异。而生物打印的心脏芯片搭载多电极阵列,可实时监测药物对动作电位(action potential)的影响。这些技术使针对MYH7相关肥厚型心肌病等遗传性疾病的定制疗法成为可能。

产业变革与挑战

尽管iPSC-AI联用将临床前周期缩短60%,仍存在三大瓶颈:类器官成熟度不足、算法“黑箱”问题,以及监管框架滞后。随着罗氏等药企已布局器官芯片生产线,这场变革正从实验室走向产业化,最终可能将抗癌药研发成本降低3.4亿美元/品种。

这场融合生物学与数字技术的革命,正在书写从“试错式研发”到“仿真式设计”的药物发现新篇章。

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