植物病原体命名法则:跨生物界分类命名的关键挑战与实践指南

【字体: 时间:2025年09月09日 来源:Annual Review of Phytopathology 11.9

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  这篇综述系统梳理了植物病原体(包括线虫、真菌、卵菌、原核生物和病毒)的命名规则与分类实践,重点解析了国际命名法规(ICN、ICNP、ICVCN等)的核心原则与最新修订,强调多学科协作对确保命名准确性(如模式标本保存、基因组序列提交)和稳定性的重要性,为植物病理学家和期刊编辑提供了跨越分类学壁垒的实用指南。

  

植物病原体命名游戏:跨越生物界的分类法则

引言

植物病原体的科学命名是跨学科交流的基石。从线虫到病毒,不同生物界的命名体系(如ICN、ICNP、ICVCN)遵循独立法规,但共享稳定性、唯一性和优先权等核心原则。例如,细菌性青枯病菌历经Burkholderia→Pseudomonas→Ralstonia的属名更迭,凸显了分类变动对命名的影响。

线虫命名:动物法规的独特挑战

线虫作为动物界成员,受《国际动物命名法规》(ICZN)约束。其分类长期依赖形态特征(如咽部结构),但分子数据(如18S rDNA)正重塑系统发育树。描述新种需提交模式标本至两个国际保藏中心(如USDA线虫库),DNA序列也可作为类型材料。有趣的是,ICZN允许命名自由度高,仅禁止冒犯性名称。

真菌与卵菌:从“植物附属”到独立王国

真菌命名原属植物法规,2012年后在《深圳法规》中专设F章。重大变革包括:取消拉丁文描述强制要求、承认无性态名称优先权(如Phyllosticta取代Guignardia)。新种发表需在MycoBank注册,模式标本须以代谢休眠状态(如冻干)保存。多基因系统发育分析(如ITS、TEF1-α)成为物种界定的金标准。

原核生物:从培养特性到基因组时代

《原核生物命名法规》历经多次修订,2022版强调全基因组平均核苷酸相似度(ANI>95-96%)作为物种边界。植物病原细菌的“致病变种”(pathovar)概念保留宿主特异性命名(如Pseudomonas amygdali pv. loropetali)。未培养菌则用"Candidatus"前缀(如‘Ca. Liberibacter’),其命名规则或将纳入主法规。

病毒:游离于生命树外的特殊体系

国际病毒分类委员会(ICTV)采用非优先权的自由命名法。2020年引入双名法(如Carlavirus trifolii),但病毒俗名仍依赖宿主+症状(烟草花叶病毒)。物种界定以基因组序列为主,要求序列提交至INSDC数据库。值得注意的是,病毒高阶分类单元(如Realm)必须形成单系群。

结语

面对分类学与命名的复杂性,跨领域合作至关重要。期刊编辑应组建分类学审稿团队,而研究者需善用国际保藏中心(如DSMZ、ATCC)和在线注册平台(如MycoBank、Zoobank)。唯有遵循“描述-保藏-注册”三位一体流程,才能确保科学命名的持久生命力。

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