解析α-突触核蛋白相分离与凝聚体老化的分子机制:β-折叠富集模体的关键作用

【字体: 时间:2025年09月10日 来源:Advanced Science 14.1

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  这篇综述通过多尺度模拟与实验相结合的方法,揭示了α-突触核蛋白(αSyn)液-液相分离(LLPS)和凝聚体老化的分子机制,鉴定出7个β-折叠富集模体(β1-β7),其中β6/β7模体通过瞬时氢键网络调控相分离边界特性,为帕金森病(PD)的早期干预提供了新靶点。

  

非单调温度依赖的α-突触核蛋白单分子特性

α-突触核蛋白(αSyn)作为帕金森病的关键病理蛋白,其单体构象呈现显著的温度依赖性。通过全原子副本交换分子动力学(REMD)模拟发现,αSyn的β-折叠含量在≈340 K达到峰值,而螺旋结构随温度单调增加。这种非单调响应与其实验观测的相分离行为一致,提示β-折叠而非螺旋结构是相分离的关键。七种β-折叠富集模体(β1-β7)被鉴定,其中β6(残基88IAAA91/F94)和β7(富含E114/D115/D119)模体表现出与相分离相似的温度响应模式,可能通过疏水"贴纸"(sticker)和静电相互作用驱动相分离。

相分离与预固化的分子驱动力

百万原子级分子动力学模拟首次捕捉到60条αSyn链的自发冷凝过程。冷凝初期形成液态凝聚体(扩散系数≈2.01×10?12 m2/s),随后β-折叠含量持续增加,分子流动性降低,呈现预固化特征。关键发现包括:

  1. 1.

    主链氢键(MC-HB)、疏水和π-π相互作用主导相分离;

  2. 2.

    β1-β5模体提供持久相互作用促进纤维化,而β6/β7通过瞬时氢键网络调控相边界;

  3. 3.

    β1-β7模体间形成渗透网络(percolated network),其中β3-β4-β5构成稳定核心,β6/β7维持动态平衡。

β6/β7模体的实验验证

粗粒化模拟显示,删除β6或β7模体会降低凝聚相密度(从358.8 K降至≈352 K)和表面张力。体外实验证实:

  • β6/β7双缺失突变体(αSynΔβ6Δβ7

  • 荧光恢复后漂白(FRAP)显示其流动性保留(恢复半衰期0.75 s vs野生型0.74 s);

  • 浊度实验证明β6/β7缺失降低相分离能力,而β1/β3缺失仅影响纤维化。

治疗启示与未来方向

研究提出"双模体调控"模型:β1-β5模体构成淀粉样纤维骨架,β6/β7模体通过动态网络维持凝聚体流动性。分子对接发现抗PD化合物claramine和LL-III倾向结合β6/β7模体,为靶向相分离的药物设计提供新思路。多尺度方法(REMD-VAE生成网络→全原子冷凝模拟→粗粒化相图)的创新组合,为研究复杂IDP的相行为建立了范式。

这项研究不仅阐明了αSyn相分离的原子机制,更鉴定出可区分相分离与纤维化的关键模体,为帕金森病的病理干预提供了精确靶点。未来工作可进一步探索β6/β7模体在αSyn与Tau、PrP等蛋白共相分离中的作用,以及温度敏感性的分子基础。

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