zDHHC5-Golgin A7棕榈酰化复合体的功能解析:非凋亡性癌细胞死亡调控新机制

【字体: 时间:2025年09月10日 来源:Journal of Biomechanics 2.4

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  本研究针对非凋亡性癌细胞死亡调控机制不明的科学问题,通过共免疫沉淀、功能实验和冷冻电镜技术,首次解析了zDHHC5-GOLGA7复合体的结构与功能,发现RNYR/RDYS基序对复合体形成的关键作用,为靶向蛋白棕榈酰化治疗癌症提供了新靶点。

  

在癌症治疗领域,诱导肿瘤细胞死亡的传统策略主要聚焦于凋亡途径。然而,一种名为CIL56的小分子化合物却能通过独特的不依赖caspase的非凋亡机制杀死癌细胞,这种死亡方式与细胞器形态改变、膜运输紊乱密切相关。更引人注目的是,这种死亡过程依赖于一个神秘的蛋白质复合体——由zDHHC5棕榈酰转移酶(palmitoyltransferase)与其辅助蛋白Golgin A7(GOLGA7)组成的死亡促进复合物。尽管前期研究已发现该复合体对CIL56诱导的细胞死亡至关重要,但其精确的三维结构、分子互作界面以及功能调控机制仍是未解之谜。

为揭开这一谜团,斯坦福大学Martha A. Kahlson团队在《Journal of Biomechanics》发表重要成果。研究人员采用冷冻电镜(cryo-EM)技术首次捕获了Zdhhc5-GOLGA7复合体的高分辨率结构,结合共免疫沉淀(co-IP)筛选和功能丧失实验,系统阐明了调控复合体组装与死亡信号传递的关键分子开关。这项研究不仅填补了非凋亡性死亡调控的结构生物学空白,更为开发靶向棕榈酰化通路的新型抗癌药物提供了理论依据。

关键技术方法包括:1)构建23种小鼠Zdhhc酶文库进行GOLGA7互作筛选;2)通过位点定向突变和缺失突变体鉴定关键基序;3)利用HEK293S GnTI-悬浮细胞系统表达复合体;4)冷冻电镜解析3.9 ?分辨率的三维结构;5)基于AlphaFold 3的预测模型指导结构解析;6)STACK活细胞成像技术定量细胞死亡动力学。

研究结果

多源Zdhhc酶与GOLGA7形成复合体

通过系统性筛选发现,除已知的Zdhhc5/8/9外,Zdhhc1/14/18也能与GOLGA7结合。进化树分析显示这些互作酶聚集在特定分支,但Zdhhc1例外,暗示存在非典型结合机制。

RNYR基序决定复合体组装

结构域定位发现Zdhhc5胞质环(含DHHC活性位点)是互作必需区域。序列比对鉴定出独特的144RNYR147基序,其中Arg147突变(RNYA)完全破坏互作,冷冻电镜显示该精氨酸与GOLGA7 Tyr76形成阳离子-π相互作用。

GOLGA7的RDYS基序反向调控

在GOLGA7及其旁系同源蛋白GOLGA7B中保守的16RDYS19基序被证实为结合关键,突变后丧失Zdhhc5招募能力。结构显示Arg16与Zdhhc5 Glu128可能形成盐桥,稳定锌指结构域构象。

冷冻电镜揭示复合体架构

3.9 ?分辨率结构显示:1)Zdhhc5含4个跨膜螺旋,胞质区含锌指结构;2)GOLGA7两亲螺旋插入膜内,类似ZDHHC20的α5螺旋功能;3)比较ZDHHC9-GOLGA7(PDB 8HF3)和酵母Erf2-Erf4复合体,发现RNYR/RDYS互作界面在进化中高度保守。

功能异质性解析

虽然GOLGA7B能替代GOLGA7恢复CIL56敏感性,但其2CS突变体(Cys78/81Ser)仍保留部分Zdhhc5结合能力,而GOLGA72CS则完全失活,表明二者棕榈酰化修饰对复合体稳定的贡献度不同。

研究结论与意义

这项研究首次从原子层面揭示了死亡促进复合体Zdhhc5-GOLGA7的组装密码:1)鉴定出RNYR/RDYS这对"分子锁钥",阐明其通过稳定锌指结构域和膜界面来维持复合体功能;2)发现GOLGA7可替代ZDHHC家族酶缺失的α5螺旋,为理解辅助蛋白的功能进化提供新视角;3)证实ZDHHC5-GOLGA7B互作不依赖棕榈酰化的特性,提示组织特异性表达可能调控死亡信号输出。

该成果具有多重转化价值:一方面,RNYR/RDYS界面可作为靶点设计小分子调控剂,精确干预非凋亡性死亡通路;另一方面,ZDHHC9中与GOLGA7互作的Pro150突变已被发现导致X连锁智力障碍,本研究为这类疾病的机制解析提供了结构模板。未来研究可进一步探索不同ZDHHC-GOLGA7组合的底物特异性,以及CIL56如何通过该复合体触发致死性棕榈酰化级联反应。

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