TNBC组织微生物组的突破性发现：揭示新型微生物玩家与三阴性乳腺癌侵袭性的关联

针对三阴性乳腺癌(TNBC)侵袭性强且缺乏有效靶向治疗的难题，研究人员通过整合4项独立研究的16S rRNA测序数据，首次系统解析TNBC组织微生物组特征。研究发现Azospirillum属及丁酸盐产生菌Gemmiger formicilis、Anaerobutyricum soehngenii的显著富集，并通过功能分析揭示其与慢性炎症、转移相关通路的关联，为TNBC的微生物驱动机制提供全新视角。

　　

三阴性乳腺癌(TNBC)作为乳腺癌中最具侵袭性的亚型，占乳腺癌相关死亡的40%，却因缺乏雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人类表皮生长因子受体2(HER2)表达而治疗选择有限。更令人困惑的是，其独特的肿瘤微环境(TME)如何驱动高转移率和复发风险，始终是未解之谜。近年来，曾被视作无菌的乳腺组织中发现的微生物群落，为这一难题提供了全新视角——这些微小生命体可能通过免疫调节、代谢产物分泌等方式参与癌症进展。然而，针对TNBC特异性微生物组的研究却长期空白，直到这项发表于《npj Biofilms and Microbiomes》的里程碑式研究出现。

为填补这一空白，研究团队采用创新的“mega-analysis”策略，整合来自美国、中国、意大利4项研究的200例乳腺癌样本16S rRNA测序数据。通过标准化生物信息学流程(OCToPUS v1.0)处理原始数据，结合ANCOM-BC校正组成偏差，并运用机器学习模型验证发现。

系统性检索结果

经过PRISMA标准筛选，最终纳入4项符合V4区域测序要求的同质化研究，包括美国两项研究(PRJNA637875、未公开数据)、中国研究(PRJNA842933)和意大利研究(PRJNA759366)，样本量涵盖74例TNBC与126例非TNBC对照。

TNBC中独特的微生物组成与多样性降低

α多样性分析显示TNBC组织微生物丰富度显著降低(P<0.05)，β多样性则通过PERMANOVA验证群落结构差异。值得注意的是，厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在TNBC中丰度锐减，而Hydrogenophilales目、Azospirillaceae科等特定类群显著富集。

丁酸盐产生菌作为潜在生物标志物

通过ANCOM-BC和MetaDE双重验证，发现3种在TNBC中上调的菌种：产丁酸的Gemmiger formicilis与Anaerobutyricum soehngenii，以及Acinetobacter indicus。功能预测揭示其与ABC转运体、群体感应通路的关联，特别是与脂肪酸合成相关的3-氧酰基-ACP还原酶的富集。

机器学习验证

基于6个差异OTUs构建的SVM模型实现79%测试准确率(ROC-AUC=81.6%)，扩展模型更将AUC提升至88.4%，证实微生物标志物的诊断潜力。

讨论部分深刻阐释了“丁酸盐悖论”现象——低浓度丁酸盐可能通过激活G6PDH促进TNBC细胞增殖，而高浓度则诱导凋亡。特别值得注意的是Azospirillum oryzae与促转移代谢物LysoPE(20:4)的关联，其patatin样磷脂酶可能通过LPA1/Gi-PLC-IP3-Ca²⁺信号级联促进转移。

这项研究不仅首次建立TNBC特异性微生物图谱，更揭示微生物-代谢物-宿主互作的新机制。未来通过类无菌小鼠模型验证这些微生物的因果作用，或将开辟TNBC诊疗的微生物靶向治疗新纪元。