模型无关同位素示踪模拟器的开发与应用

【字体: 时间:2025年09月10日 来源:Hydrological Sciences Journal 2.5

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  来自国际团队的研究人员开发了一种模型无关的同位素示踪模拟器(Model Agnostic Isotope Tracer Simulator),该工具突破了传统代谢流分析(MFA)对特定模型的依赖,通过创新算法实现了跨平台同位素标记数据的动态模拟。研究证实该模拟器可精准解析13C标记实验数据,为代谢工程和疾病代谢重编程研究提供了通用型计算框架。

  

研究人员突破性地构建了不依赖特定代谢网络模型的同位素示踪模拟平台。这个创新工具采用数学建模(Mathematical Modeling)和计算系统生物学(Computational Systems Biology)方法,能够处理包括13C、15N等多种稳定同位素标记实验数据。通过动态追踪同位素标记模式(Isotope Labeling Patterns)在代谢网络中的传递规律,该模拟器显著提升了代谢流分析(MFA)的适用范围和计算效率。技术亮点在于采用MathML编码的公式系统,配合MathJax引擎实现交互式公式可视化,用户可通过点击公式查看细节。这项发展为癌症代谢(Cancer Metabolism)研究和微生物细胞工厂(Microbial Cell Factory)优化提供了强有力的计算生物学工具。

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