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人类骨骼肌活检样本保存技术评估:冻干法、RNAlater与RNAlater-ICE在生化分析中的比较研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月11日 来源:Physiological Reports 1.9
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本文系统比较了冻干法(FD)、RNAlater(LAT)及三种RNAlater-ICE(ICE)衍生方案对人类骨骼肌样本生化指标的影响。研究发现,ICE处理完全抑制柠檬酸合酶(CS)活性,显著降低支链氨基酸(BCAA)浓度和总蛋白提取效率;LAT虽保留CS活性,但导致氨基酸泄漏和蛋白溶解度改变。结果强调保存方法选择对下游生化分析(如酶活性、代谢物检测和蛋白质印迹)的敏感性,为肌肉生理学研究提供关键方法学参考。
本研究使用的肌肉活检样本来自经瑞典伦理审查局批准的项目(DNR 2019-02194),所有参与者均签署知情同意书。
样本取自三名健康活跃个体的股外侧肌(vastus lateralis),在空腹静止状态下通过Bergstr?m针采集。样本立即称重并分为五份,分别进行以下处理:
RNAlater组:样本浸于预冷RNAlater溶液(10倍体积),4°C保存48小时后转至-30°C。
冻干组(FD):液氮速冻后冷冻干燥过夜。
RNAlater-ICE组:分为三种衍生方案:
ICE:直接浸于RNAlater-ICE溶液(-30°C,48小时);
ICE-LAT:ICE处理后转移至RNAlater溶液(-30°C,16小时);
ICE-LAT-LB:ICE-LAT处理后转移至不含Triton X-100的裂解缓冲液(冰上2小时)。
所有转移步骤均通过滤纸吸干以减少溶液残留。
样本在裂解缓冲液中通过Bullet Blender均质化,缓冲液含HEPES(40 mM, pH 7.5)、EDTA(1 mM)、NaCl(120 mM)、蛋白酶和磷酸酶抑制剂。匀浆后分装用于后续分析,部分样本经离心(10,000 g, 10分钟)获得上清液。蛋白浓度通过Pierce 660 nm assay测定。
采用分光光度法测定柠檬酸合酶(CS)活性,以DTNB为底物,在412 nm波长下监测反应速率。
通过 amyloglucosidase 消化糖原释放葡萄糖,再经 hexokinase/G6PDH 偶联反应荧光检测葡萄糖浓度。
上清液经三氯乙酸脱蛋白后,通过AccQ Tag Ultra衍生化试剂盒处理,使用LC-MS/MS定量氨基酸。
样本按蛋白浓度调整后上样,转膜至PVDF膜,MemCode?染色验证转膜效率,一抗孵育后通过化学发光法显影。
使用抗体包括:mTOR、S6K1、eEF2、CS、Pan Actin、p-eEF2(Cell Signaling Technology)、RPS6(Santa Cruz)、Fast Myosin和NDUFB8(Abcam)。
采用Friedman重复测量ANOVA与Durbin-Conover事后检验,显著性水平设为p< 0.05。
柠檬酸合酶活性:FD与LAT组活性相近(51 vs. 54 μmol·min?1·g?1),而所有ICE方案均完全抑制CS活性(0.0–1.1 μmol·min?1·g?1)。
糖原含量:所有组间无显著差异(442–494 mmol·kg dw?1)。
支链氨基酸(BCAA):所有LAT/ICE处理均显著降低BCAA浓度(52%–73% vs. FD)。
粗裂解液蛋白浓度:FD与LAT组相近(6.29 vs. 6.32 μg·μL?1),ICE方案降低30%–41%。
上清液蛋白浓度:LAT组较FD升高39%,而ICE方案降低38%–56%。
Western blot显示ICE组蛋白沉淀现象,总蛋白染色强度高于FD组,但CS蛋白含量未受影响。上清液中ICE组的肌球蛋白(myosin)完全沉淀,而LAT组溶解度增加。
本研究首次系统评估RNAlater与RNAlater-ICE在肌肉样本生化分析中的适用性。关键发现包括:
RNAlater-ICE的酶活性抑制:因其含乙醇类成分,直接变性CS等酶类,且后续处理无法逆转该效应。
代谢物泄漏:LAT与ICE均导致BCAA泄漏至保存液中,但糖原检测因高度稀释未受影响。
蛋白提取偏差:ICE引起蛋白沉淀,干扰比色法蛋白定量;LAT则增加蛋白溶解度,尤其肌球蛋白和核糖体蛋白S6(RPS6)。
方法学建议:ICE不适用于酶活性或蛋白/代谢物提取研究;LAT需谨慎用于氨基酸和蛋白分析。
本研究突显保存方法对下游数据可靠性的影响,为肌肉生理学实验设计提供关键依据。
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