Seclidemstat（SP-2577）通过逆转FET融合蛋白转录活性在多种肉瘤中展现广谱抗肿瘤潜力

本文推荐了一项针对FET（FUS/EWSR1/TAF15）重排肉瘤的重要研究，该研究证实非竞争性LSD1抑制剂seclidemstat（SP-2577）在体外能有效抑制多种罕见肉瘤细胞（包括尤文肉瘤、促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤、透明细胞肉瘤、黏液样脂肪肉瘤及融合阳性横纹肌肉瘤）的活力，并通过RNA测序证明其可逆转EWSR1::FLI1、EWSR1::WT1、EWSR1::ATF1及EWSR1::ERG等致癌融合蛋白的转录特征。研究提示seclidemstat通过干扰LSD1非酶功能（而非催化活性）破坏融合蛋白依赖性转录调控，为FET重排肉瘤提供了新的靶向治疗策略。

　　

引言

FET家族基因（包括FUS、EWSR1和TAF15）的染色体重排是多种罕见肉瘤的分子标志。这些易位产生致癌融合蛋白，通常由FET蛋白的N端低复杂度结构域（LCD）与转录因子（TF）的DNA结合结构域（DBD）构成。这些嵌合蛋白作为强效转录激活因子，驱动肿瘤发生。尽管直接靶向这些融合蛋白具有挑战性，但靶向其关键辅调节因子已成为一种有前景的治疗策略。

非竞争性LSD1抑制剂在FET重排肿瘤细胞系中显示强大活性

研究评估了seclidemstat（SP-2577）及其类似物SP-2509、OG-L002和SP-2513在多种肉瘤细胞系中的细胞毒性作用。这些细胞系涵盖尤文肉瘤（A673、TC32、SK-N-MC、TTC-466）、促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤（DSRCT；JN-DSRCT-1、BER）、透明细胞肉瘤（SU-CCS-1、DTC1）、黏液样脂肪肉瘤（1765-92、402-91、DL221）以及融合阳性横纹肌肉瘤（FP-RMS；RH4、RH30、CW9019）。结果表明，seclidemstat和SP-2509对所有这些细胞系均表现出纳摩尔级的抑制活性（IC₅₀范围从数十纳摩尔到微摩尔级），而催化性LSD1抑制剂OG-L002和无活性类似物SP-2513则无显著细胞毒性。这种活性模式表明，其抗肿瘤效应依赖于对LSD1非催化功能的干扰，而非其组蛋白去甲基化酶活性。

Seclidemstat在尤文肉瘤中重现SP-2509的转录调控作用

通过RNA测序（RNA-seq）分析，研究发现seclidemstat处理可在A673尤文肉瘤细胞中引起广泛的转录组变化，与SP-2509处理高度相似。差异表达基因（DEG）分析显示，seclidemstat上调和下调的基因与SP-2509调控的基因集存在显著重叠。基因集富集分析（GSEA）进一步证实，seclidemstat可逆转LSD1和EWSR1::FLI1调控的基因签名。具体而言，seclidemstat下调LSD1激活的基因，上调LSD1抑制的基因，并对EWSR1::FLI1的激活和抑制基因均产生逆转作用。这些发现表明，seclidemstat能有效破坏EWSR1::FLI1的转录活性，其机制可能与干扰LSD1功能相关。

Seclidemstat在多种FET重排肉瘤中引发广泛转录改变

研究扩展了转录组分析至其他FET重排肉瘤细胞系。在所有测试细胞系中，seclidemstat处理均导致数千个基因的表达发生显著改变。虽然每个细胞系中受调控的基因集存在一定独特性，但通路分析揭示了共同的下调通路（如细胞周期、RNA加工、线粒体代谢、DNA复制和干细胞程序）和上调通路（如细胞信号传导、发育过程以及EWSR1::FLI1和PAX3::FOXO1抑制的靶基因）。这些变化表明，seclidemstat通过抑制增殖相关通路和激活分化相关程序，逆转了FET融合蛋白驱动的致癌状态。

不同FET融合蛋白调控共同的基因集

通过分析公开数据集和本研究生成的RNA-seq数据，研究比较了不同FET融合蛋白（EWSR1::FLI1、EWSR1::ERG、EWSR1::WT1和EWSR1::ATF1）的转录签名。结果显示，这些融合蛋白调控的基因存在显著重叠，尤其是上调基因（共有847个共同激活的基因）。这些共同调控的基因可能反映了FET LCD介导的共通转录调控机制。此外，每个融合蛋白也调控大量独特基因，这可能源于不同DNA结合结构域的特异性及细胞背景的差异。

Seclidemstat逆转多种FET融合蛋白的转录活性

关键发现是，seclidemstat处理能有效逆转多种FET融合蛋白的转录签名。在DSRCT细胞（JN-DSRCT-1和BER）中，seclidemstat下调EWSR1::WT1激活的基因，上调其抑制的基因。类似地，在透明细胞 sarcoma细胞（DTC1）中，seclidemstat逆转了EWSR1::ATF1的转录特征。在尤文肉瘤细胞（TTC-466）中，seclidemstat也逆转了EWSR1::ERG的调控基因。这些效应在融合蛋白的直接靶基因中尤为明显，表明seclidemstat能直接干扰融合蛋白的转录调控功能。

讨论

本研究证实了seclidemstat在多种FET重排肉瘤中的广谱抗肿瘤活性，其作用机制可能涉及对LSD1非催化功能的干扰，从而破坏致癌融合蛋白的转录调控网络。与催化性LSD1抑制剂不同，seclidemstat和SP-2509均能有效抑制细胞活力并逆转融合蛋白的转录签名，提示其作用不依赖于LSD1的酶活性。这些发现支持seclidemstat作为治疗FET重排肉瘤的潜在策略，目前其正处于临床试验阶段（NCT03600649等）。未来研究需进一步阐明其具体作用机制，并探索其与其它疗法（如组蛋白去乙酰化酶抑制剂）的联合应用潜力。