癌症恶病质中人骨骼肌分子亚型鉴定及其病理机制与调控网络解析

来自多机构的研究团队通过整合非负矩阵分解（integrative non-negative matrix factorization）技术对结直肠癌和胰腺癌患者的骨骼肌RNA组进行无偏聚类分析，鉴定出两种高度一致的分子亚型。研究发现亚型1患者表现出明显的恶病质临床特征（如高程度体重减轻、低肌肉质量、IIA/IIX型肌纤维萎缩及生存率下降），并揭示其涉及转录后调控、神经元系统紊乱、细胞因子风暴、细胞免疫应答、细胞外基质通路及代谢异常等多重生物学过程，为靶向干预提供了关键分子网络基础。

　　

通过无监督聚类方法（整合性非负矩阵 factorization，iNMF）对人类骨骼肌RNA组（包含编码与非编码RNA）进行分析，在癌症患者中鉴定出两种分子亚型。其中亚型1与恶病质临床表现显著相关：包括高程度体重减轻、肌肉质量降低、IIA型和IIX型肌纤维萎缩以及生存期缩短。差异表达分析提示亚型间存在多种生物学过程异常，如转录后调控（post-transcriptional regulation）紊乱、神经元系统扰动、细胞因子风暴（cytokine storm）与细胞免疫应答、细胞外基质（extracellular matrix）相关通路改变，以及涉及异生物质代谢（xenobiotic metabolism）、止血（haemostasis）、信号转导（signal transduction）、胚胎/多能干细胞（pluripotent stem cells）和氨基酸代谢的代谢异常。研究进一步表明，长链非编码RNA（lncRNA）、微RNA（miRNA）与mRNA之间交织的高阶基因调控网络可能成为未来研究的关键靶点。