德州Lubbock topsoil中Arthrobacter globiformis噬菌体EvenBluerMoon的鉴定与基因组特征分析

来自美国德州的研究人员通过SEA-PHAGES项目，从Lubbock表层土壤中分离出感染Arthrobacter globiformis的噬菌体EvenBluerMoon，完成其全基因组测序与表征。该噬菌体属FO簇，具二十面体头部和长非收缩尾，基因组长度36,231 bp，GC含量68.8%，包含51个预测基因，为 actinobacteriophage 多样性研究提供重要资源。

　　

研究人员通过SEA-PHAGES项目，从美国德克萨斯州Lubbock地区的表层土壤（坐标33.58482, –101.87825）中分离出一种新型噬菌体EvenBluerMoon。该噬菌体可特异性感染革兰氏阳性杆菌Arthrobacter globiformis B-2979，属于噬菌体分类学中的FO簇（FO cluster），具有典型的二十面体头部（icosahedral head）和长非收缩尾（long non-contractile tail）结构。

通过Illumina NextSeq 2000平台进行全基因组测序，获得36,231 bp的双链DNA基因组，测序深度达2,424×，GC含量为68.8%。经SPAdes组装和DNAMaster注释，预测出51个编码基因，其中29个为功能未知的假设蛋白，未检测到tRNA基因。使用Bowtie2去除宿主污染，并通过Glimmer、GeneMark等工具进行基因预测。功能注释依托BLAST、HHPRED、Pfam及NCBI保守结构域数据库完成。

透射电镜（Transmission Electron Microscopy）显示该噬菌体头部直径约49.2纳米，尾长150纳米。基因组末端具有3′ sticky overhang特征，携带典型的裂解性噬菌体结构基因和复制相关基因。

本研究由霍华德·休斯医学研究所（HHMI）及德州理工大学教学学习与专业发展中心（TLPDC）支持，测序工作由SeqCoast Genomics完成。基因组数据已保存于GenBank（登录号PV329799）及SRA（登录号SRR31925871）。