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综述:甘蓝型油菜钙依赖性蛋白激酶家族快速指南
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月12日 来源:Genome 1.7
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本综述系统梳理了甘蓝型油菜(Brassica napus)钙依赖性蛋白激酶(CDPK)家族的最新研究进展,涵盖其系统发育、标准化命名、组织特异性表达模式及在生物与非生物胁迫响应中的关键作用。文章强调CDPKs作为钙信号(Ca2+)解码器,通过激酶结构域(PK)和钙调蛋白类似域(CaML)整合逆境信号,调控ROS生成、ABA信号通路及免疫应答,为抗逆育种提供潜在靶点(如BnaCPK4/5/6)。
甘蓝型油菜(Brassica napus)作为全球重要的油料作物,面临气候变化和病原胁迫等多重挑战。钙依赖性蛋白激酶(CDPKs)作为植物特有的信号转导关键分子,通过感知细胞钙浓度变化(Ca2+)并磷酸化底物蛋白,参与逆境响应与发育调控。本文综述了BnaCDPK家族的系统发育、表达模式及功能,旨在为作物抗逆改良提供理论依据。
CDPKs是一类兼具钙感应(EF-hand结构域)和激酶活性(PK结构域)的蛋白家族,通过自抑制连接区(AIJ)调控活性。其激活需特定Ca2+浓度阈值,从而解码差异钙信号。在拟南芥和水稻中,CDPKs被划分为I、II、III、IV和CRK五个亚族,其中CRK亚族因EF-hand功能缺陷曾被视为独立家族,近期系统发育研究支持其作为CDPK第五亚族。CDPKs通过调控活性氧(ROS)爆发、激素信号(如ABA)及转录因子(如WRKY家族)参与免疫应答,例如AtCPK4/5/11磷酸化AtRBOHD促进ROS生成,增强病原抗性。
通过BLAST和HMMER分析,在甘蓝型油菜Darmor-bzh基因组中鉴定出136个BnaCDPKs,多数具有N端脂化修饰位点,介导质膜定位。系统发育分析显示BnaCDPKs与拟南芥(42个)和水稻(34个)CDPKs聚为五亚族,且因多倍化存在大量共直系同源基因。采用标准化命名规则(如BnaA.CPK1.a表示A基因组AtCPK1同源基因),促进功能研究可比性。
基于植物基因表达数据库(Plant Gene Expression Omnibus)数据分析,BnaCDPKs在营养组织(根、下胚轴、叶)和生殖组织(花、雄蕊、种子)中广泛表达,部分基因呈现组织特异性。例如BnaCPK24同源基因仅在花和雄蕊中高表达,与拟南芥AtCPK24和水稻OsCPK21调控花粉管伸长的功能一致。共直系同源基因间表达模式相似,但部分基因(如BnaCPK12的12个同源体)存在差异,暗示功能分化。
黑胫病(Leptosphaeria maculans)、菌核病(Sclerotinia sclerotiorum)和根肿病(Plasmodiophora brassicae)是危害油菜生产的主要病害。转录组数据分析表明:
黑胫病感染中,抗病品系DF78(携带Rlm3/LepR1)与感病品系Westar的BnaCDPKs表达差异显著;
菌核病感染后,中油821(ZY821)抗病品系中BnaCDPKs下调幅度小于Westar;
根肿病感染中,抗病品系YJ-8的BnaCDPKs表达显著高于感病品系。
功能研究表明,BnaCPK2/6与BnaRBOHD互作并磷酸化其活性位点,促进ROS爆发和细胞死亡;BnaCPK5/6通过磷酸化BnaWRS1(WRKY转录因子)激活下游防御基因,暗示BnaCDPKs在免疫信号中的保守功能。
干旱(PEG6000模拟)、盐胁迫(NaCl)、低温(4°C)和高温(40°C)处理中双11(ZS11)品系后,BnaCDPKs呈现差异表达,其中高温胁迫显著诱导多数基因上调。分子机制上,BnaCPK4与ABA响应元件结合因子(BnaABF3/4)及蛋白磷酸酶2C(BnaAHG3/HAI3)互作,调控ABA信号和干旱应答;过表达BnaA.CPK5.a可通过磷酸化BnaABF3/4增强植株保水能力和脯氨酸积累,提升抗旱性。
尽管BnaCDPKs功能研究仍处于起步阶段,其保守的胁迫响应机制和基因编辑技术(如CRISPR/Cas9)为抗逆育种提供新策略。多倍体基因组冗余和转基因分离难题仍是挑战,但单倍体加倍技术和精准编辑技术的进展有望加速基因功能验证。以BnaCPK4/5/6等为核心靶点,通过调控ROS-ABA-WRKY网络,可望培育抗病、抗逆优质油菜品种。
研究感谢莫纳汉实验室成员的支持,以及Queen's大学提供的科研环境。土地致谢声明尊重Haudenosaunee和Anishinaabek原住民领地。
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