海洋来源黄色考克氏菌NIO_001的基因组解析及其硫肽抗生素生物合成基因簇挖掘

本研究针对海洋放线菌源高活性天然产物发现需求，来自印度的研究人员通过基因组挖掘技术解析了Kocuria flava NIO_001菌株的次级代谢潜能，成功鉴定出包括kocurin/PM181104硫肽抗生素在内的9个生物合成基因簇（BGCs），涵盖非核糖体肽（NRPS-like）、核糖体肽（RiPP-like）及萜类等类型，为通过逆向工程策略开发新型抗生素提供了重要遗传基础。

　　

通过基因组挖掘（genome mining）技术，研究人员对海洋海绵来源的黄色考克氏菌（Kocuria flava）NIO_001进行了全基因组测序与解析。该革兰氏阳性放线菌（Actinomycetia）被证实能产生强效抗菌分子kocurin/PM181104。AntiSMASH分析预测到9个具有潜力的次级代谢产物生物合成基因簇（BGCs），包括：非α型多氨基酸（NAPAA）、核糖体合成翻译后修饰肽（RiPP-like）、非核糖体肽合成酶类似物（NRPS-like）、IucA/IucC样非核糖体铁载体（NI-siderophore）、III型聚酮合酶（T3PKS）、ε-聚-l-赖氨酸（NAPAA）、萜类（terpene）以及β-内酯（betalactone）。KEGG通路分析揭示了萜类骨架合成通路和溶血素样蛋白的存在。该研究为通过逆向工程策略高产这种强效抗生素分子提供了关键遗传基础。