集成式微流控平台实现秀丽隐杆线虫(C. elegans)长时程成像、功能分析与下游蛋白质组学的单个体分辨率研究

【字体: 时间:2025年09月13日 来源:Small 12.1

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  本刊推荐一项突破性微流控技术研究,该工作开发了一种集成式平台,支持对秀丽隐杆线虫(C. elegans)从L1幼虫期至成虫的连续高分辨率成像,具备动态流体控制、自动营养供给与废物清除功能,并实现了非侵入性短暂固定。该系统可用于应激反应监测(如sod-3p::GFP报告基因)、病原体动态追踪(如Pseudomonas aeruginosa PemB毒素)及单线虫蛋白质组学分析,为发育生物学与感染模型研究提供强大工具。

  

设备设计与工作原理

该研究的核心是开发一种多层微流控芯片,由聚二甲基硅氧烷(PDMS)制成的控制层与流动层构成。系统包含20个独立单元,支持对最多20只线虫从L1阶段到成虫的并行培养与监测。设备集成多种功能阀体,包括进样阀、共同出口阀、营养供给阀、固定阀与分割阀。其中固定阀和分割阀设计为筛网阀结构,可部分关闭,实现基于尺寸的分离,从而完成连续清洗、营养供给、废物清除与后代移除。

设备通过气动压力实现线虫的机械固定,适用于成像期间的非侵入性短暂固定。每个单元内设有微通道网络,支持营养物质(如OP50大肠杆菌)的持续灌注与代谢废物的清除,构成动态自维持的微环境。该设计不仅保证线虫的正常生长与繁殖,还为其提供了一致的方向控制,有利于高通量成像与表型分析。

线虫维持与生长验证

研究通过将N2品系线虫在L1阶段加载至设备,并以恒定流速(1 μl·hr?1)灌注含OP50细菌的M9培养基,验证线虫在芯片内的正常生长与发育。线虫经历L1、L3、L4阶段最终进入成虫期,并在3天后在设备内产卵。此外,通过使用表达pGFPuv的DH5α大肠杆菌作为食物源,在线虫肠道中检测到荧光信号,证实线虫成功摄食并消化细菌。这些结果表明,该微流控系统能够支持线虫完整生命周期的不间断监测。

应激分析:SOD-3p::GFP报告基因的应用

为评估机械固定对线虫生理状态的影响,研究采用sod-3p::GFP转基因品系(CF1553),该品系通过DAF-16/FOXO3转录因子激活反映应激状态。实验设置两组:对照组仅在接受成像时进行短暂固定(2–5分钟),实验组则持续固定24小时。结果显示,长时间固定导致GFP信号显著增强,而对照组无显著变化。这表明短暂固定不会诱发可检测的应激反应,适合长时间实验;而持续固定则明显激活线虫的应激通路。

饥饿应激模型的建立

在线虫饥饿模型中,研究比较了持续喂食组与饥饿处理组(使用无细菌M9培养基灌注48小时)中sod-3p::GFP的表达变化。饥饿组线虫显示GFP信号显著上升,与充分喂食组形成鲜明对比。该结果不仅验证了芯片内应激模型的可行性,也突显了该平台在动态环境调控与应激响应监测方面的优势。

实时蛋白质定位分析

研究进一步展示了该平台在宿主-病原体互作研究中的应用。通过喂食线虫两种不同Pseudomonas aeruginosa菌株:一组为PA14Δ3tox空载体对照,另一组为表达mCherry标记PemB毒素的PA14Δ3tox/pemB菌株,利用荧光成像(488 nm与640 nm通道)追踪毒素在虫体内的时空分布。这项实验实现了对病原体毒素动态递送与定位的可视化,为感染机制研究提供了宝贵工具。

单线虫蛋白质组学分析的可行性

该研究还探索了微流控平台与单线虫蛋白质组学分析的结合。通过从单个线虫中提取蛋白质,并进行质谱(MS)分析,成功鉴定出80多种秀丽隐杆线虫蛋白质,尽管存在大量大肠杆菌背景蛋白的干扰。这一工作为在单个体水平开展蛋白质组学、转录组学分析奠定基础,有望揭示群体研究中被掩盖的生物异质性。

讨论与展望

该微流控平台在长时程线虫培养、成像与分析方面展现出显著优势:它不仅实现了从幼虫到成虫的连续监测与高分辨率成像,还整合了自动化的流体控制与后代管理功能,减少人工干预需求。与既往技术相比,该设备在维持线虫生理状态、兼容多种生物学实验(如应激响应、病原体感染、分子 profiling)方面具有明显先进性。

尽管该系统的多层气动控制结构具有一定技术门槛,但其模块化设计与可扩展性为未来技术优化与广泛应用提供可能。此外,该平台的成功开发也为其他模式生物(如斑马鱼、果蝇)的微流控研究提供了有益借鉴。

总之,这项研究提供了一种高度集成、功能全面的微流控工具,能够无缝结合发育监测、生理学分析、感染模型与分子 profiling,为发育生物学、神经科学及宿主-病原体互作等领域的研究提供了强有力的技术支撑。

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