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综述:光学功能成像的整合方法:用于类器官和小动物模型神经科学的光学、微流控与机器学习
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月13日 来源:Biophysical Journal 3.1
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本综述系统阐述了光学功能成像技术(如光片显微镜)与机器学习(ML)、微流控技术的交叉融合如何推动神经科学研究革新,重点涵盖了全脑神经活动记录、神经网络解析及发育轨迹解码等前沿方向,为类器官和小动物模型(如果蝇、斑马鱼)的研究提供关键技术支撑。
近年来,功能成像技术的突破性进展彻底改变了神经科学领域的研究方式,实现了对神经活动和细胞动态的实时观测。以光片显微镜(Light-sheet microscopy)为代表的新型成像技术,能够在模式生物(如线虫(C. elegans)和斑马鱼)中完成全脑尺度的神经记录,揭示感觉运动处理、学习机制及神经环路形成的深层原理。
随着成像数据量和复杂度的急剧增长,传统分析方法已难以应对。机器学习(Machine Learning, ML)工具的应用成为解决这一瓶颈的关键。通过去噪(denoising)、神经元与组织的自动分割(segmentation),ML 方法显著提升了数据质量,并使得研究者能够从高维数据中提取有意义的信息,例如识别特定的神经活动模式或细胞类型。
结合微流控(Microfluidics)技术,研究人员能够在类器官和小动物模型中实现对环境因素的精确控制和长期观测。这一技术整合不仅支持高通量的实验操作,更允许在接近生理条件下研究神经网络的发育轨迹(developmental trajectories)与功能调控机制。例如,在斑马鱼幼体中,通过光片成像与ML分析,科学家成功解析了其在感知刺激过程中的全脑神经动力学特征。
本文强调,成像技术与计算方法的协同是推动神经科学发现的核心动力。机器学习不仅用于后端数据分析,还可优化成像参数、指导实验设计,形成“成像-分析-建模”的闭环研究范式。这一范式有望在未来应用于更复杂的模型系统(如哺乳动物类器官),乃至为神经系统疾病的研究提供新视角。
尽管技术融合带来巨大机遇,但仍面临数据标准化、算法可解释性、计算效率等挑战。未来的发展需进一步打破学科壁垒,集成光学工程、计算科学和生物学等多领域知识,最终实现对神经网络结构和功能的全面解码。
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