斯里兰卡与越南肺炎住院患者中多种呼吸道病毒的检测及其公共卫生意义

本研究针对高密度人口地区呼吸道新发传染病的风险，在斯里兰卡和越南开展肺炎住院患者的病原体监测，通过泛物种PCR技术首次在越南发现犬类冠状病毒CCoV-HuPn-2018（检出率9.1%），证实该新兴病毒跨地域传播特征，为东南亚地区新发人畜共患病毒预警提供关键流行病学证据。

　　

在全球新发传染病频发的背景下，呼吸道病毒的跨物种传播已成为重大公共卫生威胁。过去几十年间，从SARS冠状病毒到甲型H1N1流感病毒，再到引发全球大流行的SARS-CoV-2，新型呼吸道病毒的不断涌现给全球疾病防控体系带来严峻挑战。流行病学家发现，病毒溢出事件往往发生在人类与动物接触密切的高人口密度地区，而东南亚地区因其生态特征和人口结构，被公认是新发传染病的热点区域。

为应对这一挑战，国际研究团队在《IJID Regions》发表了针对斯里兰卡和越南肺炎住院患者的病原体监测研究。该研究采用创新的"One Health"策略，通过建立覆盖六种病毒科的泛物种检测体系，系统性地筛查可能存在的新型人畜共患病毒。

研究团队运用多项关键技术：首先在两国医疗中心建立肺炎患者生物样本库（斯里兰卡204例，越南197例），采用WHO标准化的qRT-PCR方法进行流感病毒筛查；应用泛冠状病毒科嵌套RT-PCR检测技术（靶向RdRp基因）进行广谱病原体识别；通过Sanger测序和Illumina NextSeq 550平台进行病毒基因组解析；使用A-72犬纤维母细胞和LLC-MK2猴肾细胞系进行病毒分离培养；并采用最大似然法构建系统发育树分析病毒进化关系。

研究结果显著：

在病毒谱系特征方面，斯里兰卡样本主要检出甲型H1N1pdm09流感病毒（0.49%）、鼻病毒A59（0.49%）和冠状病毒OC43（0.49%）；越南样本则呈现出更复杂的病毒多样性，包括呼吸道合胞病毒B（RSV-B，1.0%）、人副流感病毒3型（HPIV-3，2.5%）和人类 mastadenovirus C（0.50%）。

最关键的发现是，在越南患者中首次检测到犬类冠状病毒CCoV-HuPn-2018，阳性率达9.1%（18/197）。通过系统发育分析显示，这些毒株与马来西亚分离株（GenBank MW591993）序列同源性达99.6%-99.8%，证实这是该病毒在东南亚地区的第三次独立发现事件。尽管病毒分离培养未成功，但NGS数据进一步支持该病毒在人群中的活跃传播。

研究还观察到实验室检测方法的差异：商业化多重PCR试剂盒（Luminex NxTAG RPP）与泛物种PCR在病毒检出率上存在显著差异，后者在新型病毒发现方面展现出独特优势。这种差异可能源于泛物种PCR引物设计的广谱特性，使其能够捕获常规检测可能遗漏的非典型病原体。

结论部分强调，本研究通过系统性监测证实CCoV-HuPn-2018在越南地区的存在，标志着该病毒可能比既往认知分布更广泛。作为第八个已知感染人类的冠状病毒，其公共卫生意义需要重新评估。研究结果凸显了在病毒溢出高风险地区持续开展病原体监测的必要性，特别是采用泛物种分子检测技术结合传统病毒学方法，能够有效提升新发传染病预警能力。这项研究为完善全球呼吸道传染病防控网络提供了重要科学依据，也为理解冠状病毒跨种传播机制提供了新的流行病学视角。