血红素依赖性膜定位环氧化物异构酶的功能表征与催化机制解析——以红球菌和扎瓦尔津氏菌为例

【字体: 时间:2025年09月13日 来源:Microbiology Spectrum 3.8

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  本综述聚焦于苯乙烯氧化物异构酶(SOI)的功能表征与膜定位机制,通过融合蛋白技术(SUMO/sfGFP/mCherry)实现异源过表达,结合定点突变(如H57A/R111A)、荧光显微镜定位及EPR光谱分析,揭示了SOI依赖血红素辅因子(heme)的路易斯酸催化机制(His-57为轴向配体),并证实其C端延伸区对底物通道(substrate channeling)和膜锚定功能的关键作用,为芳烃降解途径的酶工程改造提供新视角。

  

ABSTRACT

苯乙烯氧化物异构酶(SOI)是苯乙烯降解酶复合体的关键组分,负责将毒性中间体苯乙烯氧化物异构化为苯乙醛。本研究针对Rhodococcus opacus 1CP(RoSOI1)和Zavarzinia compransoris Z-1155(ZcSOI)的SOI酶,通过sfGFP标记融合技术证实其定位于E. coli细胞膜。定点突变揭示组氨酸-57(His-57)是血红素的轴向配体,而精氨酸-111(Arg-111)可能通过与血红素丙酸基团配位稳定辅因子。EPR谱学和生物催化实验进一步验证了血红素存在多种配位环境。末端延伸区的截断实验表明,N/C端结构域可能参与底物通道调控及酶复合体膜锚定功能。

INTRODUCTION

苯乙烯是化工行业核心原料,年均产量达百万吨级,广泛用于聚苯乙烯合成。微生物通过侧链加氧途径降解苯乙烯:苯乙烯单加氧酶(SMO)催化生成苯乙烯氧化物,SOI将其异构为苯乙醛,最终由苯乙醛脱氢酶(PAD)氧化为苯乙酸。SOI长期被认为无需辅因子,通过酸-碱催化机制实现Meinwald重排反应。近期研究发现Pseudomonas sp. VLB120来源的SOI含有血红素,但其膜定位假说缺乏实验证据。本研究选取具有末端延伸的RoSOI1和ZcSOI,通过融合标签策略探究其催化机制、膜拓扑及结构-功能关系。

Alphafold3-based SOI model prediction

AlphaFold3预测的RoSOI1模型(含血红素配体)在跨膜区置信度评分(plDDT >70),末端和环区灵活性较高(plDDT 50–70)。该模型与PtSOI冷冻电镜结构(PDB: 8PNV)的Cα叠加均方根偏差(r.m.s.d)为0.65 ?(152个残基),验证了模型可靠性。结构显示SOI为三聚体膜蛋白,N/C端均朝向胞质侧,活性位点隧道邻近末端延伸区(图1)。

Site-directed mutagenesis of highly conserved charged amino acids

通过SUMO/sfGFP/mCherry融合标签实现SOI异源表达,全细胞催化实验(以茚氧化物为底物)证实所有构建体均保留活性(图2)。选择SUMO标签进行定点突变,针对保守酸性/碱性残基(E51、H57、K82、D94、R111)进行丙氨酸替换。H57A和H57C突变体完全丧失活性及血红素结合能力(图4),Western blot和血红素染色验证表达及辅因子加载(图S1–S4)。膜组分活性实验显示R111A突变体血红素保留但活性显著降低,UV/VIS谱显示其蛋白-血红素比值低于野生型(图5)。EPR谱揭示野生型存在两种低自旋信号(LS1/LS2)和一种高自旋信号(HS),其中LS2(gz=2.97)可被连二亚硫酸钠还原,而R111A突变体仅保留LS2信号(图6),表明Arg-111通过稳定血红素丙酸基团影响配位环境。

Fluorescence microscopy of sfGFP-tagged SOI

sfGFP-C端融合的SOI在荧光显微镜下显示膜定位信号(图7a–f),而N端融合因游离sfGFP积累导致胞质弥散信号(图7g)。ZcSOI同样呈现膜定位特征(图7h),证实SOI为膜结合酶且两端胞质取向。活性分析表明:N端标签构建体(如SUMO-/sfGFP-RoSOI1)催化速率(kobs ~8 s?1)与野生型相当,而C端标签(尤其含柔性 linker)活性降低10倍(表1)。刚性sfGFP融合部分保留活性,提示C端延伸可能调控底物隧道构象。

Truncation of terminal extensions in SOIs

多序列比对显示SOI普遍存在末端延伸(图S8)。截断实验表明:RoSOI1的C端11残基截断(C164–167/C161–167/C157–167)导致活性降低但仍保留血红素;ZcSOI的N端26残基截断中,N1–21和N1–32完全失活,而N1–14活性提高2.5倍(图9)。所有截断体均定位于膜且保留血红素(图S9),证实末端延伸非信号肽,而是参与底物通道或酶-酶互作。

DISCUSSION AND CONCLUSION

本研究通过多技术联用揭示了SOI的血红素依赖性催化机制:His-57为轴向配体,Arg-111稳定辅因子结合。荧光显微镜明确其膜定位及胞质取向。末端延伸区截断实验表明C端调控底物通道(类似碳水化合物酯酶的隧道门控机制),N端影响催化效率。SOI可能作为苯乙烯降解途径的膜锚定平台,介导酶复合体组装。未来需进一步验证其与SMO/PAD的生理互作,为芳烃生物降解的工程应用提供理论基础。

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