突尼斯海鲈鱼源重配鱼类神经坏死病毒（RGNNV/SJNNV）近全长基因组特征及其进化意义

来自突尼斯的研究人员针对海鲈养殖中出现的病毒性神经坏死症开展病原基因组研究，成功解析一株新型重配Betanodavirus（RGNNV/SJNNV）的全基因组序列，揭示了其RNA1源于赤点石斑鱼神经坏死病毒（RGNNV）、RNA2源于伪鰺神经坏死病毒（SJNNV），为地中海地区水产病毒防控提供关键分子依据。

　　

在突尼斯萨赫尔沿海的网箱养殖场中，欧洲海鲈（Dicentrarchus labrax）于2023年8月出现大规模死亡事件，病鱼表现出病毒性神经坏死症（Viral Nervous Necrosis）的典型症状。研究人员通过SSN-1细胞系在25°C条件下成功分离到病原体，并经实时逆转录PCR（rRT-PCR）靶向RNA1段确认其为鱼类神经坏死病毒（Nervous Necrosis Virus, NNV）。

为解析病毒全基因组特征，团队采用SuperScriptTM III逆转录酶合成cDNA，随后通过9组特异性引物进行PCR扩增（其中5组靶向RNA1、4组靶向RNA2）。扩增产物经ExoSAP-IT纯化后，使用BrilliantDye Terminator v3.1测序试剂盒在ABI PRISM 3500xl遗传分析仪上进行双向测序。通过SeqScape v3.0软件组装获得近全长基因组序列。

基因组分析显示：RNA1开放阅读框（ORF）全长2,949碱基（GC含量52.2%），编码982个氨基酸；RNA2全长1,023碱基（GC含量55.3%），编码340个氨基酸。系统进化分析表明，该病毒RNA1段与赤点石斑鱼神经坏死病毒（RGNNV）聚集成簇，而RNA2段与伪鰺神经坏死病毒（SJNNV）高度同源，证实其为RGNNV/SJNNV重配病毒株。

该毒株与地中海地区已报道的20株重配毒株进行比对，显示RNA1核酸一致性达98.3%–99.1%，RNA2达97.0%–99.0%。研究首次报道了突尼斯海鲈源RGNNV/SJNNV重配病毒的全基因组序列，为理解Betanodavirus在地中海水产养殖中的进化动态和传播风险提供了重要分子流行病学数据。