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干旱条件下高粱根际细菌基因组解析及其促生与抗逆机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月13日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自亚利桑那大学的研究团队针对干旱地区高粱根际微生物组开展基因组学研究,成功完成了Sphingomonas sp.、Roseateles sp.和Promicromonospora sp.三种细菌的杂交测序与功能注释,揭示了其携带的嗜极代谢基因(如ectoine合成簇),为作物抗逆微生物组育种提供了关键基因组资源。
研究团队从干旱环境下高粱(Sorghum bicolor L. Moench)根系分离出三种根际细菌:Sphingomonas sp.(MS122)、Roseateles sp.(MS654)和Promicromonospora sp.(MS192),分别属于变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。通过牛津纳米孔长读长测序(ONT)与Illumina短读长测序杂交组装技术,获得完整环状contig,经Medaka和Polypolish抛光后评估显示基因组完整性达98.92%-100%。
经TYGS服务器比对,菌株与最近模式种的ANI值为84.7%-86.3%。PGAP注释显示Promicromonospora sp.含5,271个CDS(编码序列),GC含量72.9%;antiSMASH分析预测该菌携带ectoine合成基因簇(可增强耐盐耐热性),而Roseateles sp.则具有酰基氨基酸和铁载体合成基因。所有基因组数据已提交NCBI(登录号CP186693-CP186695),为解析微生物-植物互作机制及开发农业微生物制剂提供资源。
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