水生源裂解性铜绿假单胞菌PA14噬菌体BL5、BL8和BL9的基因组解析与系统发育研究

来自Texas Tech University的研究人员针对高耐药性机会致病菌铜绿假单胞菌PA14，从Lubbock的普拉亚湖中分离出三株裂解性噬菌体BL5、BL8与BL9，完成全基因组测序与生物信息学分析，将其归类为Caudoviricetes纲Pbunavirus属中的未分类物种。该研究为探索新型噬菌体资源及其抗生物膜应用提供重要数据支撑。

　　

研究人员从美国德克萨斯州拉伯克市的普拉亚湖（一种季节性雨水湿地）中成功分离出三株可裂解铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）PA14的噬菌体，分别命名为BL5、BL8和BL9。通过Illumina NextSeq 2000平台完成基因组测序，并利用SPAdes、bowtie2、CheckV等生物信息学工具进行组装与质量评估。

基因组分析显示，BL5、BL8和BL9的基因组大小分别为58,933 bp、61,426 bp和65,757 bp，GC含量在54.90%–59.22%之间。尽管BL5因连续注释中未发现终止密码子而被视为部分基因组，BL8与BL9则被确认为完整基因组。三者均未携带毒力基因、抗生素抗性基因或tRNA。通过FastANI比对与NCBI BLASTn分析，这些噬菌体被归类为Caudoviricetes纲Pbunavirus属中的未分类物种。其最接近的已知噬菌体分别为Pseudomonas phage vB_PaeS_PAJD-1（BL5）、Chuck（BL8）和EPa61（BL9）。

透射电子显微镜（TEM）图像显示三者均具有典型的尾部噬菌体形态，头部直径约50 nm，总长度约160 nm。系统发育树基于全基因组序列使用MAFFT和IQ-TREE构建，进一步确认它们与已知Pbunavirus成员的进化关系。

该研究不仅扩展了对环境中噬菌体多样性的认知，也为后续开发靶向多重耐药铜绿假单胞菌的噬菌体疗法提供了候选资源与基因组学依据。