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南极东岸Glaciozyma watsonii三株菌株的基因组草图解析及其低温适应机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月13日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自日本极地研究所的研究人员针对南极低温环境中具有特殊适应能力的酵母菌Glaciozyma watsonii,开展了基因组测序研究。他们成功获得了三株菌株(B-4-2、057-4-1、058-4-1)的基因组草图,揭示了其18.8–18.9 Mb的基因组规模、60.5–60.6%的GC含量以及高覆盖度的测序数据。该研究为解析酵母在冰冻环境中的生长机制及开发新型低温活性酶提供了重要遗传资源。
研究人员从南极东部昭和站附近的因霍夫德地区(69°51′S, 37°06′W)分离出三株Glaciozyma watsonii酵母菌。这类酵母以具备冰结合蛋白(ice-binding proteins)和冷活性酶(cold-active enzymes)而著称,甚至在零下温度仍能保持生物活性。
该研究通过Illumina HiSeq 2500平台对三株菌株进行双端测序(151 bp×2),使用Platanus进行基因组组装,并通过RepeatModeler和RepeatMasker鉴定重复序列。结果显示,三株菌的基因组大小在18.8–18.9 Mb之间,GC含量为60.5–60.6%,Scaffold N50在268–306 kb之间,测序覆盖度达235×至316×。
值得注意的是,G. watsonii能在?3°C的冷冻琼脂培养基上生长,甚至在?80°C冻结后仍可复苏。其基因组数据不仅有助于揭示该菌在极端低温环境下的适应机制,还有望为新型药物原料的开发提供线索。
该研究由日本极地研究所(NIPR)、日本学术振兴会(JSPS)及大阪发酵研究所等共同支持,相关基因组数据已提交至GenBank(登录号:BAAHZA010000000.1、BAAHZB010000000.1、BAAHZC010000000.1)和DRA(登录号:DRR118805–DRR118810)。
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