揭秘槟榔果腐病病原体——棕榈疫霉（Phytophthora meadii）P19分离株的首个基因组解析及其致病机制研究

来自印度的研究人员针对槟榔种植园中由棕榈疫霉（Phytophthora meadii）引起的严重果腐病问题，开展了该病原体的首次基因组研究。通过整合长短读长测序技术，成功组装了高毒力分离株P19的参考基因组（58.74 Mb，439 scaffolds），并结合转录组数据预测了蛋白编码基因、效应因子（RxLR/CRN）、碳水化合物活性酶等关键致病因子，为探索病原体侵染机制及病害防控提供了重要资源。

　　

研究人员通过整合短读长与长读长测序技术，首次对高毒力棕榈疫霉（Phytophthora meadii）P19分离株进行了基因组解析。该基因组由439个支架(scaffolds)构成，总长度为58.74 Mb。同时，利用Trinity软件组装获得28,522条菌丝转录本，经CD-HIT聚类后得到20,964条代表性序列，为基因预测提供了转录组证据。研究通过生物信息学分析揭示了以下基因组特征：蛋白编码基因与非编码基因、RxLR与CRN效应因子、基因密集/稀疏区域、碳水化合物活性酶(CAZymes)、基因直系同源群、正选择作用下的基因以及水平基因转移的证据。这一高质量参考基因组将为深入探索棕榈疫霉的致病分子机制提供关键基础。