综述:癌症中的tRNA甲基化

【字体: 时间:2025年09月14日 来源:Medicine in Omics

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  本综述系统阐述了tRNA甲基化(如m7G、m5C、m6A等)在肿瘤发生中的动态调控机制及其对翻译精度、tsRNA生成和肿瘤微环境的重编程作用,为靶向RNA表观遗传(epitranscriptome)的癌症治疗策略提供了新视角。

  

1. 引言

转移RNA(tRNA)作为蛋白质合成的核心分子,通过其高度保守的三叶草结构和L形三维构象识别信使RNA(mRNA)上的密码子,并携带对应氨基酸参与多肽链组装。tRNA的转录后修饰(PTM)是调控其功能的关键机制,其中甲基化是最常见的修饰类型,占已知RNA修饰的50%以上。甲基化过程由甲基转移酶("writers")、去甲基化酶("erasers")和识别蛋白("readers")动态调控,影响tRNA的稳定性、折叠构象和翻译准确性。近年研究发现,tRNA甲基化异常可通过改变密码子使用偏好性(codon usage bias, CUB)和生成tRNA衍生小RNA(tsRNAs),直接参与肿瘤增殖、转移、免疫逃逸等恶性表型。

2. tRNA N7-甲基鸟苷(m7G)在癌症中的作用

m7G修饰主要位于tRNA可变区第46位,通过与C13-G22形成氢键稳定tRNA三维结构。METTL1/WDR4复合物是哺乳动物中m7G的主要催化酶,其过表达在膀胱癌、头颈鳞癌(HNSCC)和食管鳞癌(ESCC)中通过增强富含AGA密码子(如EGFR、PIK3CA)的mRNA翻译,激活EGFR和PI3K/AKT/mTOR信号通路,促进肿瘤增殖和侵袭。在鼻咽癌(NPC)中,m7G修饰的tRNA-Lys-UUC上调WNT3A表达,诱导上皮间质转化(EMT)和化疗耐药。此外,m7G还通过调控5'-末端寡鸟苷片段(5'-TOGs)影响免疫微环境:METTL1缺失导致5'-TOGs积累,破坏m7G帽结构与翻译起始复合物的结合,激活IFN-STAT1通路并促进M1型巨噬细胞极化,增强免疫检查点阻断(ICB)疗效。

3. tRNA 5-甲氧基羰基甲基-2-硫尿苷(mcm5s2U)的肿瘤调控功能

mcm5s2U修饰由ELP复合物、ALKBH8和CTU1/2协同催化,位于tRNA摆动位置(U34),显著影响翻译保真度。在乳腺癌中,ELP3和CTU1/2介导的mcm5s2U修饰促进DEK癌蛋白的翻译,后者结合LEF1 mRNA的IRES序列激活WNT通路,驱动肿瘤转移。在肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中,ELP3通过增强Ric8b和线粒体核糖体蛋白(MRPL)的翻译,促进mTORC2信号和M2型极化,重塑肿瘤代谢微环境。相反,TRMT9B介导的mcm5s2U修饰在结直肠癌中上调LIN9表达,诱导G0-G1期阻滞和衰老样表型,发挥抑癌作用。

4. tRNA N6-甲基腺苷(m6A)的动态修饰

m6A修饰由METTL3/METTL14复合物催化,并可被FTO、ALKBH3/ALKBH5去甲基化。ALKBH3作为tRNA特异性去甲基酶,在胰腺癌中通过增强新生蛋白质合成促进肿瘤增殖。针对ALKBH3的小分子抑制剂(如茚满酮、瑞亨酸)在实验中显示抗肿瘤活性,提示其作为治疗靶点的潜力。

5. tRNA N1-甲基腺苷(m1A)的致癌机制

m1A修饰由TRMT6/TRMT61A等酶催化,稳定tRNA结构并调控翻译效率。在肝癌干细胞中,TRMT6/TRMT61A介导的m1A58修饰增强PPARδ的翻译,激活胆固醇合成和Hedgehog信号通路,加速肿瘤生长。在膀胱癌中,m1A修饰的tRF-3b片段失去基因沉默功能,导致MBTPS1和CREB3L2表达上调,激活未折叠蛋白反应(UPR)促进肿瘤存活。

6. tRNA 5-甲基胞苷(m5C)与代谢可塑性

NSUN2和NSUN3分别调控细胞质和线粒体tRNA的m5C修饰。NSUN3介导的mt-tRNA-Met m5C34修饰可进一步氧化为f5C,通过调节OXPHOS亚基翻译增强线粒体代谢,促进口腔鳞癌的侵袭和转移。NSUN2则通过抑制氧化应激下的tRNA切割(如angiogenin介导的tRFs生成),维持蛋白质合成稳态。

7. 其他tRNA修饰的潜在作用

m5U(由TRMT2A/B催化)和2'-O-甲基化(由SNORD97/FTSJ1催化)主要通过保护tRNA免受应激性切割影响肿瘤进展。例如,FTSJ1介导的tRNA-Sec Um34修饰增强硒蛋白(GPX1/4)合成,帮助黑色素瘤细胞清除活性氧(ROS)并促进转移。

8. tRNA甲基化的靶向治疗前景

METTL1、NSUN2、TRMT6/TRMT61A等酶在多种癌症中高表达且与不良预后相关,已成为潜在治疗靶点。小分子抑制剂如STM2457(靶向METTL3)、Nsun2i-4(靶向NSUN2)和Thiram(靶向TRMT6/61A)在临床前模型中显示抗肿瘤效果。联合免疫检查点抑制剂(如抗PD-1)可协同增强疗效。

9. 挑战与展望

当前tRNA甲基化研究仍面临技术瓶颈,如修饰位点检测困难、组织特异性表达差异等。未来需开发高灵敏度检测技术(如质谱法、单分子测序),并基于酶结构设计特异性抑制剂。同时,tsRNAs作为新型生物标志物和治疗靶点的潜力亟待深入探索。

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