综述:蚊媒黄病毒多尺度建模的机遇

【字体: 时间:2025年09月14日 来源:BioSystems 1.9

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  本综述系统探讨了蚊媒黄病毒(如登革热病毒(DENV)、寨卡病毒(ZIKV)等)的多尺度建模研究进展,涵盖从细胞内病毒复制机制到群体传播动态的多层次模型整合。重点分析了温度对病毒传播的影响及多尺度模型在疫苗开发、疫情预测和公共卫生干预中的应用价值,为虫媒病毒防控提供了重要理论支撑。

  

细胞内建模

蚊媒黄病毒的细胞内模型聚焦病毒复制分子机制。黄病毒科(Flaviviridae)的生命周期始于病毒与宿主细胞表面受体结合(图3A),经内化后病毒RNA基因组在胞浆中释放。该基因组作为模板通过细胞核糖体翻译成多蛋白,经宿主和病毒蛋白酶切割形成病毒蛋白。病毒蛋白包括解旋酶(NS3)、RNA依赖性RNA聚合酶(NS5)等非结构蛋白,共同构成复制复合体(RC)负贵合成新的病毒RNA。

病毒RNA合成采用半保守机制:正链基因组RNA复制产生负链中间体,继而生成新的正链RNA。新合成的正链RNA可继续参与翻译、复制或包装成新生病毒颗粒。模型常采用常微分方程(ODEs)描述这些过程,例如通过质量作用定律构建的病毒RNA和蛋白动力学方程。关键参数包括病毒RNA合成速率(ksyn)、降解速率(δ)及核糖体结合效率等。

温度对细胞内过程具有显著影响:高温加速酶促反应但可能破坏蛋白稳定性,低温则延缓复制速率。登革热病毒(DENV)和西尼罗河病毒(WNV)的复制最适温度约为37-39°C,而寨卡病毒(ZIKV)在34°C显示更高复制效率,反映其母婴传播特性。

宿主内建模

宿主内模型刻画病毒在单个宿主体内的感染动态和免疫应答。对于蚊媒病毒,此类模型需区分脊椎动物宿主(如人类)和蚊媒载体(如伊蚊)的独特生物学特性。典型脊椎动物急性感染中,病毒载量呈现快速上升、达峰后衰减的趋势,例如寨卡病毒感染后约两周病毒清除。

模型常采用房室建模法,将宿主分为易感细胞(T)、感染细胞(I)和病毒颗粒(V)等房室,基本再生数(R0)决定感染是否建立。免疫应答包括先天免疫(干扰素应答)和适应性免疫(抗体中和、T细胞清除)。登革热病毒(DENV)的抗体依赖性增强(ADE)效应通过Fcγ受体介导的病毒内吞增强感染,是二次感染重症化的关键机制。

温度在宿主内尺度同样重要:蚊媒载体作为变温动物,环境温度调控其体内病毒外孵育期(EIP)。温度升高加速病毒在蚊媒中的复制,缩短外孵育期,增加传播风险。模型通过阿伦尼乌斯方程量化温度对病毒复制速率的影响。

传播模型

传播模型捕捉宿主间病毒扩散动态,预测疫情规模、持续时间和峰值。蚊媒病毒传播涉及人-蚊交互,基本再生数R0的计算需考虑蚊媒叮咬率、感染期时长和传播概率等参数。SEIR模型(易感-暴露-感染-移除)及其变体是常用框架,其中人类和蚊群分别建模并通过叮咬项耦合。

温度通过影响蚊媒生命周期(产卵率、存活率)和病毒外孵育期塑造传播动态。研究表明,登革热病毒(DENV)传播的最适温度约为29-35°C,超出此范围则传播效率下降。空间异质性(如城市化水平、人口流动)和季节波动也被纳入现代传播模型。

多尺度模型的未来机遇

多尺度模型通过连接不同尺度过程回答关键科学问题,例如细胞内病毒复制如何驱动宿主内感染,或宿主间交互如何引发流行病。现有少数多尺度模型已探索尺度间动态关系,如将细胞内RNA复制模型与宿主内免疫应答耦合,预测抗病毒药物效果;或将宿主内病毒动力学与群体传播模型整合,评估疫苗策略。

温度作为跨尺度关键参数,为多尺度整合提供天然纽带:分子水平的酶动力学参数、宿主水平的免疫应答强度、群体水平的蚊媒丰度均受温度调节。未来需开发多尺度计算框架,整合实时气候数据、病毒基因组学和人蚊接触模式,提升疫情预测精度。

结论

多尺度模型极大增强了对蚊媒黄病毒(如DENV、ZIKV、WNV)的理解,尤其在评估干预措施方面价值显著。通过整合细胞内、宿主内和群体水平动态,这些模型为公共卫生响应提供 nuanced 视角。当前挑战包括参数化不同尺度模型、处理数据粒度的不匹配以及计算复杂性。未来应加强模型与实验数据的迭代验证,特别关注温度依赖性过程的量化,从而优化疫苗设计和疫情应对策略。

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