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山东及周边省份鹅圆环病毒的分子流行病学与遗传进化分析揭示Cap蛋白高突变特征及免疫逃逸潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月15日 来源:Postharvest Biology and Technology 6.8
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本研究针对鹅圆环病毒(GoCV)在山东及邻省的流行现状,通过PCR检测与全基因组测序,揭示了10株GoCV分离株的遗传进化关系。研究发现Rep蛋白高度保守,而Cap蛋白存在多位点突变,三维结构预测显示局部构象差异可能影响病毒毒力与免疫逃逸能力。该研究为GoCV区域防控和疫苗研发提供了关键分子依据。
在禽类养殖业中,鹅圆环病毒(Goose circovirus, GoCV)作为一种重要的病原体,自1999年于德国首次发现以来,已对全球水禽健康构成持续威胁。该病毒可引起鹅只生长迟缓、羽毛杂乱、体重下降等临床症状,严重时导致羽毛脱落和毛囊坏死,更关键的是它会攻击免疫系统,造成免疫抑制,从而引发多种继发感染。由于GoCV难以通过传统细胞培养或鸡胚接种方式分离,其病原生物学特性与遗传变异规律的研究一直存在瓶颈。近年来,中国作为鹅养殖大国,山东及周边省份的养殖场频繁出现疑似GoCV疫情,但缺乏系统的分子流行病学数据与遗传进化分析。为此,山东农业大学的研究团队开展了本次研究,旨在揭示该区域GoCV的流行株遗传特征、变异模式及其与鸭圆环病毒(DuCV)的演化关系,相关成果发表于《Postharvest Biology and Technology》。
研究团队采集了2024年山东、河北、河南及安徽四省病鹅样本,通过PCR初步筛选出GoCV阳性样本,从中选择10株进行全基因组扩增与测序。主要技术方法包括:基于已知序列设计特异性引物进行PCR检测;使用两对引物(GoCV-F1/R1和GoCV-F2/R2)分段扩增全基因组;通过DNAStar软件组装序列,MEGA11进行系统发育树构建与同源性分析;利用BioEdit分析氨基酸突变位点,并采用生物信息学方法预测Rep和Cap蛋白的三维结构。
研究结果如下:
一、GoCV PCR检测鉴定结果
通过451 bp特异性条带确认10株GoCV阳性,分别命名为GoCV/1-655/SD/2024至GoCV/11-685/HN/2024,来源覆盖山东德州、聊城、荷泽及安徽宿州、河北邢台、河南信阳。
二、GoCV全基因组检测与测序结果
所有毒株基因组长度均为1821 nt,分属GoCV-Ⅰ和GoCV-Ⅱ基因型。
三、GoCV全基因组同源性比较与遗传进化分析结果
全基因组核苷酸同源性为96.9–99.5%,与河南HN20du株同源性最高(97.1–99.6%),与广东GoCV-297-GD-2020株最低(93.4–94.4%)。氨基酸同源性为94.4–99.3%。系统发育显示9株属GoCV-Ⅰa分支,1株属GoCV-Ⅰb分支,与DuCV亲缘关系远。
四、GoCV Rep蛋白同源性比较与遗传进化分析结果
Rep基因长882 nt,核苷酸同源性96.6–99.7%,氨基酸同源性99.3–100%。进化树与全基因组一致,确认GoCV-Ⅰa为主要流行分支。
五、GoCV Cap蛋白同源性比较与遗传进化分析结果
Cap基因长753 nt,核苷酸同源性96.8–99.3%,氨基酸同源性98.0–100%。Cap蛋白突变率高于Rep,进化树显示所有毒株均属GoCV-Ⅰa。
六、Rep和Cap蛋白的氨基酸突变分析与蛋白结构预测结果
与国内首株GoCV(AY633653.1 yk1)相比,Rep蛋白在4、5、47、71位点发生突变(如47位D→E);Cap蛋白在8、26、49、59、61、74、76、78、176、186位点突变(如26位K→R)。三维结构预测显示整体构象高度相似,但局部区域存在差异,可能影响病毒毒力与免疫逃逸。
研究结论与讨论部分强调,GoCV在山东及周边省份存在明显地理传播与遗传多样性,Rep蛋白高度保守,适于作为PCR诊断靶点;Cap蛋白高频突变可能导致免疫逃逸,增加疫苗研发挑战。与DuCV的远缘关系说明两者存在种属分化,但近期研究提示跨宿主传播与重组可能发生。本研究的局限在于未进行病毒分离与功能验证,未来需进一步探索免疫抑制机制与多价疫苗设计。持续监测GoCV变异趋势对早期防控至关重要,尤其需关注水禽贸易与候鸟迁徙带来的传播风险。
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