新型吡唑衍生物的设计合成及其抗氧化、抗菌与抗有丝分裂活性的综合生物学评价(体外与计算机模拟研究)

【字体: 时间:2025年09月17日 来源:Journal of Fluorescence 3.1

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  本研究针对新型吡唑衍生物开展系统性生物学评价。来自某团队的研究人员通过设计合成化合物7a-b,综合运用NMR、质谱、体外活性筛选及计算机模拟技术,发现7b展现出卓越的抗氧化活性(IC50 = 0.85 ± 0.02 μmol/mL)、显著抑制金黄色葡萄球菌(抑菌圈16.3 mm)及强抗有丝分裂作用(抑制率达80%)。ADME/毒性预测、分子对接、分子动力学(MD)和DFT计算进一步揭示其良好成药性与稳定性,为抗菌/抗肿瘤药物开发提供新候选。

  

本研究深入探讨了合成吡唑衍生物7a-b的多维生物学活性,涵盖抗氧化、抗菌、抗有丝分裂及有丝分裂指数测定。在通过核磁共振(NMR)与质谱完成结构表征后,研究发现衍生物7b表现出优异的抗氧化能力,其在2.5 μmol/mL浓度下抑制率达到75.19 ± 0.11%,半抑制浓度(IC50)为0.85 ± 0.02 μmol/mL,显著优于7a(IC50 = 1.44 ± 0.13 μmol/mL)。在抗菌实验中,7b对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)显示出16.3 mm的抑菌圈,而7a抗菌效果较弱,尤其对革兰氏阴性菌。在抗有丝分裂活性方面,7b可抑制60%的种子萌发,7a则无此效应。有丝分裂指数分析进一步表明,7b在20 μmol/mL下抑制率高达80%,与阳性对照秋水仙素(colchicine)效果相当,7a的影响则十分有限。

在计算机模拟(in silico)层面,化合物7a展现出与多个生物靶点的强结合能力。在抗氧化靶点Kelch-Neh2蛋白对接中,其对接得分为-9.08 kcal/mol,并与包括Thr560在内的14个残基发生相互作用;在抗菌方面,其针对DNA旋转酶(DNA gyrase)的对接得分达-6.77 kcal/mol,优于标准药物,并与Gly77、Asn46形成氢键;在抗有丝分裂研究中,7a与微管蛋白(tubulin)结合口袋的对接得分为-7.19 kcal/mol,与Asn258等残基形成稳定作用。ADME分析提示该化合物具有高吸收性和中等程度的P-糖蛋白(P-glycoprotein)相互作用。毒性预测表明其不具备致癌性、致突变性、细胞毒性及免疫毒性。

通过密度泛函理论(Density Functional Theory, DFT)计算,7a显示出良好的电子特性,如较低能隙(0.2011 eV)、适中偶极矩及较高软度,这些参数支持其潜在的生物活性与稳定性。分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟证实了三个复合物在100 ns内结构稳定,均方根偏差(RMSD)值维持在1.2–2.4 ?范围内。MM-GBSA结合自由能分析进一步表明,ΔGbind值在整个模拟时间内保持强烈负值,说明结合过程稳定。主成分分析(PCA)与概率密度函数(PDF)分析一致表明7a相较于参考化合物具有更一致的构象稳定性,自由能景观(Free Energy Landscape)分析结果则提示其处于稳定且能量有利的构象状态。

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