基于蛋白质组学的多组学揭示涡虫再生中转录-翻译-蛋白质动态路线图

本研究针对组织再生调控机制不明确的科学问题，由研究人员通过质谱蛋白质组学技术建立涡虫(Schmidtea mediterranea)光谱库，结合RNA-seq和Ribo-seq多组学分析，发现核糖体蛋白的翻译水平上调和肌钙蛋白T通过蛋白质稳定性调控再生起始的新机制，为再生生物学提供了转录非依赖的蛋白质调控新视角。

　　

通过建立覆盖约10,000种蛋白质的涡虫(Schmidtea mediterranea)光谱库，研究团队采用定量蛋白质组学技术揭示了再生过程中的蛋白质动态变化。研究发现特定核糖体蛋白在再生早期呈现翻译水平上调，该现象通过核糖体图谱测序(Ribo-seq)得到验证。整合RNA测序(RNA-seq)与Ribo-seq的多组学分析，将蛋白质丰度增加机制归类为转录水平、翻译水平和蛋白质稳定性三个调控维度。功能筛选鉴定出25个对涡虫再生至关重要的蛋白质，其中肌钙蛋白T(Troponin T)在转录和翻译水平上调前就出现蛋白质丰度增加，表明其受到蛋白质稳定性调控。该研究首次揭示了核糖体介导的翻译依赖型调控和转录非依赖的蛋白质稳定性调控在涡虫再生起始中的关键作用。