肠道拟杆菌目利用外源DNA代谢新机制：ddbABCDEF基因座驱动核苷碱基生成

来自国际研究团队的研究揭示了人类肠道拟杆菌目代谢外源DNA的分子机制。该研究通过遗传学和生化手段鉴定出Bacteroides thetaiotaomicron中关键的ddbABCDEF基因座，证实其可将DNA降解产物转化为脱氨基碱基（尿嘧啶和黄嘌呤），为理解肠道微生物核酸代谢提供了新范式，对宿主-微生物互作研究具有重要意义。

　　

人类肠道微生物组在营养代谢中扮演核心角色，但外源核酸在该生态系统中的归宿尚未明确。本研究证实多种拟杆菌目（Bacteroidales）物种可高效代谢外源DNA，其中Bacteroides thetaiotaomicron能将其转化为脱氨基核苷碱基尿嘧啶（uracil）和黄嘌呤（xanthine）。通过遗传学与生物化学手段，研究人员鉴定出六基因簇ddbABCDEF——该基因座编码分泌性核酸酶和外膜转运蛋白，是外源DNA代谢的关键元件。采用ddbABCDEF突变株定植无菌小鼠的实验表明，该通路显著改变了无菌小鼠模型中的核苷碱基池。比较基因组学分析显示，ddbABCDEF与拟杆菌门（Bacteroidota）天然转化系统存在进化关联，并分化为四种不同代谢亚型，各亚型在近缘肠道拟杆菌菌株中对应独特的DNA处理功能。这些发现拓展了对肠道微生物DNA代谢的认知，揭示了一条具有宿主-微生物互作意义的核苷碱基合成新途径。