孟加拉国新城疫弱毒疫苗株BCRDV全基因组测序及其抗原特性与系统发育分析

来自孟加拉国的研究人员针对新城疫(ND)防控需求，完成了Baby Chick Ranikhet Disease Vaccine (BCRDV)疫苗株的全基因组测序。该研究通过Illumina平台二代测序技术解析了15,186 bp的基因组结构，证实其F蛋白裂解位点呈典型弱毒株特征(GRQGR↓L)，系统发育分析显示其与LaSota等弱毒株聚类，抗原预测评分达0.5620，为ND疫苗研发提供重要分子基础。

　　

研究人员成功解析了孟加拉国新城疫(Newcastle Disease, ND)弱毒疫苗株BCRDV的完整基因组序列。该疫苗株源自新城疫病毒(NDV/APMV-1)的弱毒株(lentogenic strain)，通过鸡胚传代培养获得。基因组测序采用Illumina NextSeq 2000平台，经Trimmomatic质控和SPAdes^v3.14.0组装后，获得长度为15,186 nt的基因组，覆盖6个开放阅读框(ORF)，GC含量为46%。

基因排列顺序为3′-NP-P-M-F-HN-L-5′，其中融合蛋白(Fusion protein, F)的裂解位点序列为¹¹²G-R-Q-G-R↓L¹¹⁷，该特征性 motif 证实了其弱毒属性。通过BLASTn比对显示，该序列与克罗地亚NDV株(KJ670427.1)相似度达99.69%，与孟加拉国弱毒株(ON713865.1)相似度为99.66%。

系统发育分析表明，BCRDV与LaSota(JF950510)、Hitchner-B1(AF309418)等经典弱毒株聚于同一进化枝。抗原性预测工具VaxiJen评估显示其抗原评分为0.5620，提示具有较高保护性抗原潜力。本研究为ND疫苗的分子设计及流行病学研究提供了关键基因组学数据。