在鱼类水产养殖中，通过口服方式给予抗生素所引发的微生物风险，在法律规定的抗生素停药时间过后仍会持续存在很长时间

《Nature Water》：Microbial risks triggered by oral administration of antibiotics in fish aquaculture persist long after the legally mandated antibiotic withdrawal time

鲤鱼肠道中氟苯尼考处理后抗生素抗性基因（ARGs）残留及传播机制研究，显示停药期抗性基因丰度未恢复基线，整合子及质粒介导的ARG传播显著，长期处理组菌群携带更多多样抗性质粒，质粒与染色体ARG序列高度相似。

　　

摘要

工业化水产养殖依赖氟苯尼考等抗生素来防治疾病并维持生产，但关于使用后的微生物风险（尤其是抗生素抗性基因（ARGs）的问题仍知之甚少。为了解决这一问题，我们在普通鲤鱼（Cyprinus carpio）中模拟了标准剂量和延长剂量的氟苯尼考处理，并对其肠道中的抗性组、可移动基因组和微生物组进行了宏基因组分析。研究结果表明，氟苯尼考的使用导致了抗性组的显著变化：虽然处理后的抗性基因丰度有所下降，但在规定的停药时间之后仍高于对照组水平。整合子和携带floR基因的转座子促进了抗性基因的传播。在延长剂量处理后的鱼肠道微生物群中，携带抗性基因的质粒种类比对照组更多。尽管优势微生物群具有一定的抵抗力，但仍有一些携带抗性基因的细菌数量增加。在那些数量增加的潜在病原菌中，有47.1%的细菌携带与质粒上相同的抗性基因。值得注意的是，质粒和染色体上抗性基因侧翼序列的高度相似性凸显了质粒在抗性基因转移中的关键作用。总体而言，氟苯尼考处理增加了鲤鱼肠道中抗性基因的丰度和移动性。即使在规定的停药时间之后，抗性组和可移动基因组的特征仍未恢复到基线水平，这表明该时间段不足以降低抗性基因的传播风险。