长日照诱导甜菜开花转变的全转录组测序与ceRNA调控网络解析

本研究针对甜菜光周期开花调控机制，通过全转录组测序技术鉴定出518个差异mRNA、214个lncRNA、369个miRNA和7个circRNA，构建了包含7个ceRNA调控网络，发现VAL1-like、FT蛋白和COL10等关键因子参与长日照开花诱导，为甜菜开花分子机制研究提供新视角。

　　

植物王国中，光周期诱导开花的信号首先被叶片感知。成花素(florigen)在叶片中合成后运输至茎尖，启动营养生长向生殖生长的转变。本研究通过长日照与短日照条件下甜菜叶片的全转录组测序(whole-transcriptome sequencing)，不仅探索了与开花发育相关的RNA分子（包括mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)），还构建了竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络以揭示甜菜开花转变的分子机制。研究鉴定到518个差异表达mRNA、214个lncRNA、369个miRNA和7个circRNA，发现ABC转运蛋白、含B3结构域的转录抑制因子VAL1-like、EXORDIUM蛋白、FT互作蛋白1(FT-interacting protein 1)、开花位点T蛋白(FLOWERING LOCUS T)、TCP4转录因子和锌指蛋白CONSTANS-LIKE 10等在开花转变中起关键作用。成功构建7个与光周期诱导开花相关的ceRNA共表达调控网络，涉及7个mRNA、7个miRNA、5个lncRNA和1个circRNA。结果表明B3结构域转录抑制因子VAL1-like、开花位点T蛋白(FT)和锌指蛋白CONSTANS-LIKE 10可能响应长日照条件参与开花调控，这些发现为深入解析甜菜开花转变的调控机制提供了重要理论基础。