《Spanish Journal of Legal Medicine》：A posteriori informativity in standard paternity tests with the Investigator Argus X-12 system and mutation findings
编辑推荐：
X-STR分型系统在墨西哥亲缘鉴定中的应用及突变率分析。采用FamlinkX软件对74个家庭的 trio 和 duo 案例进行后验信息量（LR）计算，结果显示三组案例LR显著高于预期（3.98E+04），且在复杂亲缘关系中（如母女半姐妹、祖母-孙女等）LR值达到6.0E+07。检测到9次突变事件，估算出7个X-STR位点的突变率（0.0062-0.0124），并首次报告DXS10148的null等位基因。
Eduardo Rojas-Prado|Irán Cortés-Trujillo|Mayra E. García-Aceves|Mariana Chávez-Arreguín|Karina González-Becerra|Alma F. Favela Mendoza|Héctor Rangel-Villalobos
墨西哥哈利斯科州奥科特兰市瓜达拉哈拉大学（CUCI-UdeG）Ciénega大学中心医学与生命科学系分子遗传学研究所
摘要 引言 Argus X-12检测试剂盒是用于人类身份识别的宝贵工具，尤其在解决复杂的亲缘关系案件时非常有用。对这些案例的分析可以为常规法医工作提供有价值的信息，如后验信息量（LR：似然比）和
突变率 。
目的 分析Argus X-12 QS试剂盒在74个墨西哥家庭中的表现，这些家庭分别包括父亲、母亲和女儿。
方法 使用FamlinkX软件计算了这些家庭中的精确似然比（LR），其中包括父亲、母亲和女儿组成的三联体案例（n = 74；平均值为8.1E+14）以及仅包含父亲和女儿的双联体案例（n = 148；平均值为6.1E+11），在此过程中省略了母亲的信息。
结果 三联体案例的后验似然比显著高于典型的先验参数IP（3.98E+04）。作为参考，我们报告了使用X-STRs解决的复杂亲缘关系案例的似然比：母系同父异母姐妹（LR = 111）、父系同父异母姐妹（LR = 5567）、父系同父异母姐妹与她们的母亲（LR = 6.0E+07）以及祖母与孙女（LR = 15,864）。在161次减数分裂过程中检测到9个突变。7个X-STR的突变率为：DXS10148、DXS10135、DXS8378、DXS10146和DXS7423为0.0062（1/161），而DXS10074和DXS10101为0.0124（2/161）。这些发现将在未来的荟萃分析中发挥作用，以获得更可靠的估计结果。在一对母女中检测到DXS10148的
空等位基因 ，这一结果得到了通过8步突变（26.1 → 18）解释该现象的概率较低以及26.1等位基因
纯合子 频率较低的支持。
结论 Argus X-12在本文描述的亲子关系和亲缘关系案例中的后验信息量证明了将其纳入法医
遗传学 实验室的必要性。
引言 近几十年来，X染色体短串联重复序列（X-STR）标记已被纳入法医遗传学实验室中用于人类身份识别的标记库。
1 这是因为它们的遗传模式有助于解决涉及至少一名女性的复杂亲缘关系案例，例如在没有父亲的情况下确定祖母与孙女的关系、确定父系兄弟姐妹或同父异母姐妹的关系、排除乱伦情况，以及在亲属数量较少时识别失踪人员。
2 , 3 利用X-STR进行亲缘关系分析需要考虑等位基因和单倍型频率，同时也要考虑基因连锁和连锁不平衡（LD）
4 , 5 ，FamLinkX软件利用这些信息来估算亲缘关系指数或似然比（LR）
6 。此外，每个X-STR的突变率对于解释亲缘关系评估中的异常结果和避免错误结论至关重要。
7 , 8 Argus X-12检测系统（Qiagen）分析了4个连锁组中的12个X-STR，每个组包含3个X-STR
1 , 3 这可能是应用最广泛的基于X-STR的试剂盒，因为FamlinkX软件提供了许多用于法医分析的人口数据（
http://www.famlink.se/fx_download.html ），使其易于在任何实验室中实施。大多数法医遗传学研究都报告了不同的先验参数，如杂合度（Het）、多态性信息含量（PIC）、典型亲子关系指数（PI）、区分能力（PD）和平均排除概率（MEC），以及等位基因和单倍型频率
9 , 10 。然而，实际亲子关系案例的后验参数（如LR）在全球范围内很少被报道，但这些参数有助于揭示遗传系统在法医日常工作中的实际贡献
11 , 12 。本研究基于包含父亲、母亲和女儿的墨西哥家庭，使用FamlinkX计算的精确似然比来评估Argus X-12系统的后验信息量。这些结果结合了5个涉及不同类型同父异母姐妹关系的复杂亲缘关系案例、祖母与孙女关系以及有母亲在场的叔侄关系的数据进行了讨论。此外，还描述了在这些墨西哥家庭中发现的一个空等位基因和9例由突变引起的排除结果，这些发现有助于估算所涉及的7个X-STR的突变率。尽管分析样本量不足以直接估算突变率，但这些发现将对未来的荟萃分析具有参考价值。
样本 从74个家庭中收集了包含父亲、母亲和女儿的血液样本，共计235份样本（161次减数分裂事件）（补充材料S1）。除了使用Argus X-12试剂盒进行分析外，还通过PowerPlex? Fusion系统（Promega Corp.）中的22个常染色体STR确认了他们的亲属关系。血液样本在FTA纸上的小圆片（1.2毫米）先用FTA纯化试剂（Whatman?）清洗，再用无DNA酶的水处理后直接用于检测。
后验亲缘关系的信息量（LR） 通常，法医遗传学中的群体研究使用先验法医参数或模拟来评估基因座和/或遗传系统的信息量。然而，对实际解决案例的后验信息量（LR）进行分析也能提供有价值的数据，即使仅来自单个家庭。11, 12, 13 在本研究中，我们对74个具有确证亲缘关系的墨西哥家庭使用基于Argus X-12试剂盒的FamlinkX软件估算了不同的后验亲缘关系参数。
结论 总之，通过对包含女儿和确认亲子关系的墨西哥家庭的研究，我们估算了Argus X-12试剂盒的信息量，以确定标准的亲子关系。文中还描述了几个使用X-STR解决的复杂亲缘关系案例作为参考。根据研究结果，我们估算了7个X-STR的突变率，并在DXS10148中检测到一个可能的空等位基因。
伦理责任 参与者签署了符合《赫尔辛基宣言》的知情同意书。该项目得到了瓜达拉哈拉大学Ciénega分子遗传学研究所研究伦理委员会的批准。本研究中的志愿者始终保持匿名。
资金支持 墨西哥国家科学技术委员会（CONACyT）为H. R-V提供了编号为286623的资助，为E. R-P提供了奖学金，为M.E. G-A提供了编号为664279的博士后奖学金。QiAGEN-Mexico部分资助了该项目。
作者贡献 Eduardo Rojas-Prado、Irán Cortés-Trujillo和Mayra E. García-Aceves共同参与了这项研究。
