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基于多组学与计算机模拟探究艾拉莫德(Iguratimod)在哮喘-COPD重叠综合征中的作用机制与治疗前景
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月19日 来源:Biochemical and Biophysical Research Communications 2.2
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本文通过整合bulk与单细胞RNA测序数据(scRNA-seq),结合生物信息学与分子模拟技术,系统解析了哮喘-COPD重叠综合征(ACO)的分子机制,并揭示小分子药物艾拉莫德(IGU)通过靶向TNF、CCL等炎症核心靶点(如2AZ5、4MBS蛋白)及调控NF-κB通路,展现潜在治疗价值,为ACO精准干预提供新策略。
Bulk RNA sequencing data collection and analysis
批量RNA测序数据收集与分析
从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取了数据集GSE199853(用于批量RNA测序分析)的预处理数据。在该数据集中,我们比较了健康组与疾病组(包括哮喘-COPD重叠综合征ACO、哮喘和COPD)的样本,以筛选差异表达基因(DEGs)。预处理数据被导入R环境,并利用Bioconductor工具包进行下游分析。
Bulk RNA sequencing
批量RNA测序
首先使用“edgeR”工具包中的“CountsPerMillion”(CPM)函数对数据进行过滤和标准化,基因表达量以log2值表示。随后,利用“limma”工具包中的“voom”函数提取COPD、哮喘和ACO样本中的差异表达基因(DEGs)。差异基因的筛选标准为p值 < 0.05 且 log2倍数变化(logFC)> |1|。
Discussion
讨论
哮喘-COPD重叠综合征(ACO)是一种重要的呼吸系统综合征,其特征为持续性气流受限,并同时具备哮喘和慢性阻塞性肺疾病(COPD)的临床表现。2014年,全球哮喘防治倡议(GINA)与全球慢性阻塞性肺病防治倡议(GOLD)联合发布声明,将ACO定义为“具有通常与哮喘相关的多项特征和通常与COPD相关的多项特征的持续性气流受限”。
CRediT authorship contribution statement
作者贡献声明
Neelima Sharma: 撰写-审阅与编辑,可视化,概念化;
Shirsha Mitra: 验证,软件,调研,数据整理;
Sayak Khawas: 撰写-初稿,可视化,方法论,形式分析,数据整理。
Data availability statement
数据可用性声明
相关数据见补充文件。
Ethical Approval
伦理批准声明
本研究未涉及人类或动物受试者,因此无需伦理批准。
Declaration of Competing Interest
利益冲突声明
作者声明无利益冲突。
Funding
资助声明
作者声明在文稿撰写过程中未获得任何资金、资助或其他支持。
Acknowledgements
致谢
印度梅斯拉伯拉技术学院(Birla Institute of Technology, Mesra, Ranchi)对本研究提供了支持。
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