中国零售金针菇中单核细胞增生李斯特菌的全基因组测序分析揭示公共卫生风险

本研究针对中国零售金针菇中单核细胞增生李斯特菌(Lm)的基因组特征不明的问题，通过对全国24省144株分离株进行全基因组测序分析，发现高比例的高毒力菌株（81.9%）及与临床菌株的高度遗传相关性，证实金针菇作为Lm食源性传播媒介的风险，为加强食品安全监测提供重要科学依据。

　　

在食品安全领域，单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes, Lm）始终是一个令人警惕的名字。这种食源性病原体可引起李斯特菌病，对孕妇、新生儿、老年人和免疫低下人群尤其危险，死亡率高达20%-30%。近年来，欧美国家多次爆发与污染金针菇相关的李斯特菌病疫情，引发了国际社会对这种常见食用菌安全性的高度关注。然而，在中国，尽管金针菇消费广泛，但对其中存在的Lm污染情况及其潜在风险却缺乏系统性的基因组学研究。这些菌株究竟属于哪些基因型？它们是否携带高毒力因子？与临床患者分离株是否存在关联？这些问题直接关系到公共卫生安全风险的评估与防控策略的制定。

为了回答这些问题，赵健云、李兰琪、李梦晗、杨大进、严琳、农瑛瑛、闫少飞和白莉研究团队开展了一项系统性的基因组学研究，相关成果发表在《International Journal of Food Microbiology》。研究人员于2021年从中国24个省区市的零售金针菇中分离得到144株Lm菌株，并采用全基因组测序（Whole Genome Sequencing, WGS）技术对其进行全面分析。研究重点包括分子分型（血清型、序列型及克隆复合体）、毒力基因分析（包括李斯特菌致病岛LIPI-1至LIPI-4以及inlA基因）、应激生存岛（SSI-1）的检测，并通过核心基因组单核苷酸多态性（cgSNP）分析比较食用菌分离株与临床分离株之间的遗传关系。

关键技术方法包括：从全国24省份零售金针菇中采集并分离Lm菌株；全基因组测序与高质量基因组组装；多位点序列分型（MLST）和核心基因组MLST（cgMLST）分析；毒力因子岛（LIPI-1至LIPI-4）与应激生存岛（SSI-1）的鉴定；系统发育与单核苷酸多态性（SNP）分析。

分子分型显示与临床菌株高度一致

通过全基因组测序和分子分型，所有分离株被划分为两个谱系：谱系I（54株）和谱系II（90株）。优势克隆复合体（CC）为CC8、CC87、CC14和CC5，该分布与我国临床Lm菌株的序列型（ST）分布高度一致，提示金针菇可能是人群李斯特菌感染的重要来源。

高比例菌株被鉴定为高毒力或毒力型

依据世界卫生组织/粮农组织（WHO/FAO）基于LIPI-1至LIPI-4及inlA基因的分类标准，81.9%的分离株被归类为高毒力或毒力菌株。这些菌株不仅具备完整的关键毒力基因簇，还显示出潜在的强致病能力，进一步证实其公共卫生风险。

食用菌分离株与临床菌株遗传关系密切

cgSNP分析显示，金针菇来源的Lm菌株，特别是CC8/ST8、CC87/ST87及CC14/ST91，与中国临床患者分离株遗传关系高度接近。这一结果为食源性传播提供了有力的基因组流行病学证据。

多数菌株携带应激生存岛SSI-1

研究发现56.3%的菌株携带应激生存岛SSI-1，该遗传元件有助于细菌在食品加工环境（如低温、高盐、酸性条件）中存活和持续存在，增强了Lm在金针菇生产、储存和流通过程中的污染风险。

该研究首次在全国范围内系统揭示零售金针菇中Lm的种群结构、毒力特征和遗传关联性，明确指出金针菇是高毒力Lm菌株的潜在储存宿主和传播媒介。结果强调，必须加强对食用菌产品中Lm的持续性监测和风险预警，特别是在生产加工环节中控制SSI-1阳性菌株的存活与扩散。这项研究不仅为食品安全风险评估提供关键数据，也为制定针对性的李斯特菌病防控策略提供了重要科学依据，对保障公众健康具有显著的现实意义。