华东地区污水监测揭示人类爱知病毒基因多样性及流行规律——基于新一代测序技术的系统发育研究

本研究针对中国爱知病毒(AiV)流行病学及遗传多样性数据匮乏的问题，来自中国的研究人员通过2019–2022年济南污水监测，采用新一代测序技术(NGS)定量分析AiV基因组并扩增VP1区。结果显示AiV检出率达95.83%，发现基因型A(100%)与B(52.50%)共循环现象，揭示污水系统中显著的病毒遗传多样性，为分子流行病学研究提供重要技术范式。

　　

通过新一代测序技术对2019–2022年中国东部济南市污水样本中的人类爱知病毒(AiV)进行检测与系统发育特征分析。研究显示AiV与胃肠炎症状相关，而污水监测已成为评估其流行率的有效手段。

在为期四年的研究中，月度污水样本的定量分析显示AiV基因组浓度介于1.4×10³至2.7×10⁵基因组拷贝/升之间，并呈现明显的夏秋季高发季节特征。通过扩增污水浓缩物中的VP1区域进行测序，发现济南序列聚集于基因型A和B的三个群组，平均p-距离为0.091。基因型A存在于所有样本(100.00%)，而基因型B见于52.50%样本，其相对丰度分别占总清洁读长的86.06%和13.94%。

该研究首次在中国污水样本中应用扩增子NGS技术检测AiV，揭示了多种传播谱系的持续共循环及废水系统中显著的遗传多样性。结果表明NGS技术显著提升检测灵敏度，为AiV分子流行病学提供了更全面的数据支撑。