中国林下散养鸡源大肠杆菌、志贺氏菌及沙门氏菌的流行特征与耐药性分析

为解决自由放养鸡场中抗菌药物耐药性（AMR）传播问题，研究人员开展针对大肠杆菌（E. coli）、志贺氏菌（Shigella flexneri）和沙门氏菌（Salmonella enterica）的流行特征与耐药谱研究，发现三者对氧四环素（OTC）、新霉素（NEO）等常用抗生素呈现高耐药率，且存在多重耐药（MDR）现象，为制定针对性干预策略提供关键数据支撑。

　　

随着全球人口增长和城市化进程加速，人类对动物源性蛋白的需求持续攀升，鸡肉作为重要的蛋白质来源，其生产方式正朝着集约化、规模化方向快速发展。然而，这种生产模式的转变也带来了传染病传播风险的增加，特别是家禽中潜伏的病原性细菌，不仅威胁动物健康，还可能通过食物链传递给人类，成为公共卫生的重大挑战。抗菌药物自发现以来，在治疗感染性疾病中发挥了关键作用，但全球范围内约73%的抗菌药物被用于食品动物，过度使用和滥用已成为抗菌药物耐药性（AMR）产生的主要推手。2019年，AMR相关死亡人数接近500万，对世界经济构成严重威胁，尤其在南亚和撒哈拉以南非洲地区，耐药病原体导致的死亡率居高不下。

在这一背景下，自由放养鸡养殖模式因其更接近自然的生产环境而受到关注，但同时也面临生物安全控制难度大、病原体传播风险高等问题。特别是在中国甘肃省舟曲县，林下养殖鸡群以天然草料、种子和昆虫为主要饲料来源，鸡只白天户外觅食，夜晚归舍，这种开放式的养殖环境使得病原体传播难以有效遏制。目前，针对此类养殖系统中细菌流行情况及抗菌药物敏感性模式的研究仍较为缺乏，阻碍了有针对性的干预措施的制定。

为此，研究人员在舟曲县的七个林下养殖场中，采集了1315份临床样本，包括口咽拭子、泄殖腔拭子、新鲜粪便及肠道内容物，旨在评估主要病原菌的流行情况及其对11种常用抗菌药物的耐药性特征。所有样本均经过标准化细菌培养、VITEK 2系统鉴定、Kirby-Bauer纸片扩散试验以及PCR分子检测，并结合16S rDNA测序与生物信息学分析，对病原菌进行准确鉴定与耐药性分析。

研究结果显示，大肠杆菌（E. coli）的分离率最高，达14.52%，其次为志贺氏菌（Shigella flexneri）（6.54%）和沙门氏菌（Salmonella enterica）（4.94）。药敏分析表明，大肠杆菌对氧四环素（oxytetracycline, OTC）、头孢噻呋（ceftiofur, FUR）和氨苄西林（ampicillin, AMP）的耐药率高达100%，对多西环素（doxycycline, DOX）（94.76%）、新霉素（neomycin, NEO）（85.34%）和泰乐菌素（tylosin, TYL）（61.78%）也表现出较高耐药性。志贺氏菌则对新霉素（66.28%）、氧四环素（61.63%）和青霉素（penicillin, PEN）（58.14%）耐药率较高，而沙门氏菌对新霉素（66.15%）和氧四环素（61.54%）的耐药较为突出。值得注意的是，多重耐药（MDR）菌株占总分离株的27.27%，突显了AMR问题的严重性。

进一步通过VITEK 2系统对七大类抗菌药物进行敏感性分析，结果显示所有受试菌均对至少一类药物表现出耐药。大肠杆菌被判定为广泛耐药（XDR），对青霉素类、四环素类、氨基糖苷类、大环内酯类和头孢菌素类均存在耐药，其多药耐药指数（MAR index）为0.54；志贺氏菌符合MDR标准，对三类药物耐药，MAR指数为0.27；沙门氏菌未达到MDR标准，MAR指数最低（0.18），提示其治疗选项相对较多。

研究人员在讨论中指出，自由放养鸡养殖中抗菌药物的广泛使用可能是导致病原菌AMR发展的重要原因，尤其像大肠杆菌这类常见共生菌的耐药性演变，为禽类健康管理带来了严峻挑战。与上海、尼泊尔等地的研究相比，本次调查中大肠杆菌的MDR率（54.54%）相对较低，可能反映出地区间AMR发展差异。志贺氏菌和沙门氏菌的流行率与国内外其他报告基本一致，但其耐药特征显示了对常用药物的显著耐受，这为制定区域化感染控制策略提供了依据。

在技术方法层面，本研究采用多阶段样本预处理、选择性培养基培养、生化鉴定（如三糖铁试验、吲哚试验等）、自动化药敏系统（VITEK 2）以及分子生物学手段（16S rDNA测序与系统发育分析），全面评估了病原菌的分类地位与耐药表型。样本来源于出现严重健康问题的鸡群，包括表现腹泻、翅膀下垂、高热等症状的活禽及死禽，确保了数据的临床相关性。

结论部分强调，该项研究系统揭示了中国舟曲县林下散养鸡中三种主要病原菌的流行与耐药现状，突出了AMR对禽类健康、生产效益及食品安全的潜在威胁。结果表明，大肠杆菌、志贺氏菌与沙门氏菌均对多种常用抗菌药物表现出高水平耐药，且存在一定比例的MDR菌株。这一发现不仅为当地养殖业的疫病防控提供了直接依据，也为更大范围内AMR的监测与治理策略的制定提供了重要数据支持。研究成果发表于《Poultry Science》，对促进抗菌药物的合理使用、开发替代型治疗策略以及保障食品安全均具有积极意义。