靶向铁死亡揭示五味子甲素治疗类风湿性关节炎的潜在机制:整合生物信息学与实验研究

【字体: 时间:2025年09月20日 来源:Biochemistry and Biophysics Reports 2.2

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  本研究针对类风湿性关节炎(RA)治疗中存在的药物疗效有限和副作用显著等问题,通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了中药活性成分五味子甲素(SCHA)通过靶向TXNRD1/LPCAT3/SLC7A11调控铁死亡通路抑制FLSs炎症的新机制,为RA治疗提供了新的潜在治疗策略和药物开发靶点。

  

类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis, RA)是一种让人备受折磨的自身免疫性疾病,患者不仅承受着关节肿痛的痛苦,还面临着关节畸形和功能丧失的风险。这种疾病的病理核心在于滑膜组织的慢性炎症和异常增生,其中成纤维样滑膜细胞(Fibroblast-like Synoviocytes, FLSs)扮演着关键角色——它们就像"炎症发动机"一样,持续产生大量的炎症因子和基质降解酶,不断加剧关节破坏。虽然目前有抗炎药、免疫抑制剂和生物制剂等治疗选择,但往往效果有限且伴随显著副作用。在这种背景下,传统中药展现出独特优势,而五味子中的活性成分五味子甲素(Schisandrin A, SCHA)正是备受关注的研究对象。

为深入探究SCHA的治疗潜力,研究人员在《Biochemistry and Biophysics Reports》上发表了这项整合性研究。他们采用了多学科交叉的研究策略:首先通过生物信息学分析筛选GEO数据库中的转录组数据集(GSE181614和GSE205795),识别差异表达基因;利用Metascape进行功能富集分析和String数据库构建蛋白质相互作用网络;采用密度泛函理论计算SCHA的电子结构特性;运用分子对接和分子动力学模拟研究SCHA与靶蛋白的相互作用;最后通过体外实验验证,包括细胞活力检测(CCK-8法)、ELISA检测炎症因子、生化指标测定(qPCR和Western blotting)以及透射电镜观察超微结构变化。

3.1. 差异表达基因筛选

研究人员通过比较RA患者与正常对照FLSs的转录组数据,以及SCHA处理与未处理RA FLSs的数据,鉴定出48个与SCHA抗炎作用相关的共同差异表达基因。这些基因在RA炎症状态下表达异常,而经SCHA处理后表达水平发生逆转,提示它们可能是SCHA发挥作用的关键靶点。

3.2. 功能和通路富集分析

富集分析结果显示,这些差异表达基因显著富集于铁死亡(Ferroptosis)通路,该通路在RA FLSs中激活,而在SCHA处理后受到抑制。基因集富集分析进一步证实,铁死亡相关基因集在RA组中显著富集,而在SCHA处理组中下调,表明SCHA可能通过抑制铁死亡发挥抗炎作用。

3.3. PPI网络构建和分析

蛋白质相互作用网络分析识别出TXNRD1、LPCAT3和SLC7A11作为关键枢纽基因。这些基因在铁死亡通路中扮演重要角色:TXNRD1和SLC7A11是铁死亡的负调控因子,而LPCAT3是正调控因子。在RA中,TXNRD1和SLC7A11表达下调,LPCAT3表达上调;SCHA处理逆转了这种异常表达模式。

3.4. 密度泛函理论分析和分子对接

密度泛函理论计算显示SCHA具有较高的HOMO-LUMO能隙(5.365 eV),表明其分子结构稳定。分子对接结果表明SCHA与TXNRD1、LPCAT3和SLC7A11具有良好的结合亲和力,结合自由能分别为-5.33、-7.24和-6.42 kcal/mol,主要通过氢键和疏水作用形成稳定复合物。

3.5. 分子动力学模拟

100 ns的分子动力学模拟证实了SCHA-蛋白复合物的稳定性。RMSD、RMSF、Rg和SASA等参数分析表明复合物在整个模拟过程中保持结构稳定,氢键数量和相互作用能计算进一步验证了结合的稳定性。主成分分析显示复合物在构象空间中分布集中,表明结合状态稳定。

3.6. 细胞活力测定

CCK-8实验表明,SCHA在60-240 μM浓度范围内对正常MH7A细胞无毒性,并能剂量依赖性地 ameliorate LPS诱导的细胞活力下降,说明SCHA具有保护FLSs免受炎症损伤的作用。

3.7. SCHA对促炎细胞因子的影响

ELISA和qPCR结果显示,SCHA剂量依赖性地抑制LPS诱导的IL-6、TNF-α和IL-1β表达上調,在蛋白和mRNA水平均观察到一致的效果。铁死亡抑制剂Erastin也表现出类似的抗炎效果,证实了铁死亡在RA炎症中的重要作用。

3.8. SCHA对铁死亡生物标志物的影响

生化指标检测表明,SCHA处理显著逆转了LPS引起的抗氧化酶(GSH-Px和SOD)活性下降和脂质过氧化产物(MDA)、Fe2+及ROS水平升高。透射电镜观察显示SCHA剂量依赖性地保护线粒体形态,减轻铁死亡特征性的线粒体损伤,如线粒体皱缩、膜溶解和嵴破裂。

3.9. SCHA对铁死亡相关基因的影响

Western blotting和qPCR分析证实,SCHA剂量依赖性地逆转了LPS引起的TXNRD1和SLC7A11表达下調以及LPCAT3表达上調,在蛋白和转录水平均保持一致,表明SCHA通过转录调控影响这些关键铁死亡调控因子的表达。

研究结论和讨论部分强调,该研究首次系统地阐明了SCHA通过靶向调控TXNRD1、LPCAT3和SLC7A11表达抑制铁死亡,从而减轻RA FLSs炎症反应的分子机制。铁死亡作为一种铁依赖性的调节性细胞死亡形式,在RA病理过程中发挥着重要作用——它通过引起脂质过氧化、氧化应激和炎症因子释放,加剧滑膜炎症和关节破坏。SCHA通过上調抗氧化蛋白TXNRD1和胱氨酸/ glutamate转运体SLC7A11,增强细胞抗氧化能力;同时下調脂质代谢酶LPCAT3,减少多不饱和脂肪酸掺入磷脂,降低脂质过氧化敏感性,从而全面抑制铁死亡进程。

这项研究的重要意义在于:一方面揭示了铁死亡在RA发病机制中的关键作用,为理解RA病理生理提供了新视角;另一方面明确了中药活性成分SCHA的作用靶点和分子机制,为其进一步开发为抗RA药物提供了坚实的理论基础和实验依据。特别是SCHA同时调控多个铁死亡关键靶点的特点,使其可能比单一靶点抑制剂具有更好的治疗效果和更低的副作用风险。未来研究可进一步探索SCHA在RA动物模型中的治疗效果,并优化其给药策略,推动其向临床转化。

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