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卡塔尔旱地土壤原生生物多样性研究:环境DNA宏条形码技术揭示TSAR类群生态适应机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月20日 来源:European Journal of Protistology 1.6
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本研究通过环境DNA(eDNA)宏条形码技术,首次系统解析卡塔尔Rawdha与Sabkha两种典型旱地生境中TSAR(Telonemia, Stramenopila, Alveolata, Rhizaria)类群的原生生物多样性。研究发现Alveolata(囊泡虫类)占比超50%,Spirotrichea(旋毛纲)与Colpodea(肾形纲)为优势纤毛虫类群,功能群以消费者为主导。该研究为极端高温环境下微生物适应性机制提供了重要理论依据。
我们通过对卡塔尔两种典型旱地生境(rawdha和sabkha)的土壤原生生物群落进行研究,利用针对18S rRNA基因V4区的环境DNA宏条形码技术,从100份样本中获得112,529条高质量序列,鉴定出1524个TSAR(Telonemia, Stramenopila, Alveolata, Rhizaria)扩增子序列变异(ASVs)。该方法成功检测到多种真核生物谱系,并实现了对其多样性和相对丰度的评估。
经质量过滤后,从100个样本的112,529条序列中共获得1524个TSAR扩增子序列变异(ASVs),这些ASVs代表Stramenopila(不等鞭毛类)、Alveolata(囊泡虫类)和Rhizaria(根状虫类)的生物类群。在所有采样点均未检测到Telonemia(端丝虫类)。
Rawdha和sabkha生境的土壤群落存在显著统计学差异(PERMANOVA, p=0.0027)。不同采样点之间以及同一生境内不同样本间也观察到显著差异。在所有样本中共鉴定到170个属,其中52个属为所有点位共有。Sabkha生境拥有最多特有属(22个),几乎是任一rawdha点位的三倍。在多数样本中,Alveolata(囊泡虫类)支系占总属丰富度的50%以上。在纤毛虫中,Spirotrichea(旋毛纲)和Colpodea(肾形纲)在采样时最为丰富。功能分析显示消费者(consumers)为优势营养类群。
Rawdha和sabkha被确认为生态特征迥异的生境。Rawdha土壤通常更肥沃,而sabkha土壤相对贫瘠(Al-Thani and Yasseen, 2021)。土壤肥力与微生物群落的组成和活性密切相关(Xiong et al., 2018)。正如预期,PERMANOVA揭示两种生境类型间的群落结构存在显著统计学差异。
总而言之,卡塔尔旱地土壤两种生境类型的原生生物群落包含SAR支系所有三个类群的代表。SAR类群的大量存在凸显了其对极端条件(高温、低湿度、高盐度以及氮磷等必需营养元素匮乏)的适应能力。这种韧性可能与灵活的生活史策略(包括形成包裹和营养机会主义)有关。
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