亚甲蓝与SARS-CoV-2病毒孔道相互作用的分子模拟及其抗病毒机制研究

本研究由来自俄罗斯的研究团队开展，聚焦于SARS-CoV-2病毒孔道（viroporin）与亚甲蓝（MB）的分子相互作用机制。通过伞采样分子动力学模拟，发现MB与病毒孔道中心苯丙氨酸残基通过芳香环堆叠作用非共价结合，揭示了MB抗病毒作用的结构基础，为开发新型病毒孔道抑制剂提供了关键理论依据。

　　

病毒孔道（viroporin）是包膜病毒的小型膜蛋白，在病毒生命周期和疾病发病机制中起关键作用。抑制病毒孔通道成为治疗冠状病毒、疱疹病毒、人类免疫缺陷病毒（HIV）、埃博拉病毒等疾病的重要策略。本研究通过伞采样（umbrella sampling）分子动力学模拟方法，解析了亚甲蓝（Methylene Blue, MB）与SARS-CoV-2病毒孔道的相互作用。结果表明，MB分子与病毒孔道中的苯丙氨酸（phenylalanine）残基通过非共键π-π堆叠（stacking interactions）发生特异性结合，这一发现深化了对MB抗病毒机制的理解，并为基于结构的病毒孔道抑制剂开发提供了计算实验依据。