鄱阳湖候鸟源大肠杆菌多重耐药性及移动遗传元件多样性研究

本研究系统分析了鄱阳湖候鸟源大肠杆菌（E. coli）的多重耐药性（MDR）与移动遗传元件（MGEs）多样性，揭示了整合子（Integrons）与抗生素耐药性（AMR）的显著关联，为野生动物源耐药菌传播机制研究提供重要依据，对控制耐药基因（如blaCTX-M-2、dfrA1）的生态传播具有警示意义。

　　

Highlight

菌株分离与鉴定

2021年9月至10月期间，我们从穿越中国江西省鄱阳湖候鸟保护区的150只候鸟粪便样本中分离出114株大肠杆菌（每份新鲜样本仅取一株分离菌）。所有分离株均通过麦康凯培养基生长试验、伊红美蓝琼脂生长试验和革兰氏染色进行验证。最终通过16S rRNA基因测序完成菌株鉴定。所有确认的分离株均保存在-80°C的甘油管中，以备后续分析。

Isolation and characterization of E. coli

本研究在2021年9月和10月对飞越鄱阳湖的150只候鸟进行采样，从其粪便样本中共分离到114株大肠杆菌。分离结果显示，培养后可见具有黑色金属光泽的单菌落。典型菌落经革兰氏染色后，显微镜检查显示为革兰阴性短杆菌。以16S rRNA为引物进行扩增，PCR产物通过1.5%琼脂糖凝胶电泳检测——可见一条约1500 bp的明亮条带，与预期大小一致。

Discussion

大肠杆菌是一种广泛存在于自然环境中的常见细菌。随着抗生素的广泛使用，其耐药性问题日益突出。尽管抗生素在畜牧业中提高了畜禽生产性能、改善了患病动物和人类的健康，但滥用导致环境中抗生素残留增加，加速了耐药菌的出现和传播。

Conclusions

本研究从150只候鸟中分离纯化出114株大肠杆菌，进行了多重耐药性（MDR）检测和移动遗传元件（MGEs）多样性分析。结果表明，这些大肠杆菌存在严重的MDR现象。通过基因序列比对发现，菌株具有复杂多样的MGEs。其中，I型整合子阳性菌株对强力霉素（DOX）、四环素（TET）、杆菌肽（BCT）、链霉素（STR）和新霉素（NEO）的耐药性显著高于阴性菌株；II型整合子阳性菌株对强力霉素（DOX）和头孢唑肟（CTZ）的耐药性也显著更高。