六元钒螯合环构象分析及其对配合物稳定性与生物活性的影响

【字体: 时间:2025年09月22日 来源:Journal of Inorganic Biochemistry 3.2

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  本综述通过数据挖掘系统分析钒配合物中六元螯合环(含NVN、OVN、OVO等单元)的构象分布,揭示配体构象与配合物稳定性及抗癌活性的关联性,为设计高效生物活性金属药物提供结构基础。

  

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Materials

如我们先前研究钒配合物几何构型的工作所述,本研究中的结构均取自剑桥晶体学数据中心(CCDC)收录的配合物。通过下载CCDC中的结构并获得晶体学信息文件(CIF),随后在Mercury软件(版本2024.3.1)中进一步查验以确认配合物几何构型。这些结构的图像与分析均通过该软件完成。

Structures with six-membered rings containing NVN unit

在104个含NVN单元六元环的配合物中,86个为单核,16个为双核,1个为四核,1个为七核配合物。这些配合物中共有51个呈现椅式构象,20个为扭船式,19个为船式,6个为半椅式,3个具有多重环构象(1个为椅式与扭船式组合,1个为船式与扭船式组合),另有5个结构未在CCDC中收录(详见表1)。图4展示了三个代表性配合物:其一为单核钒(V)配合物(CCDC编号:JODXAI),其六元环采取经典椅式构象;其二为双核钒(IV)配合物(CCDC编号:VECZUW),呈现扭船式构象;其三为七核钒(V)氧簇配合物(CCDC编号:IMIVOX),其螯合环为船式构象。

Discussion

本研究通过数据挖掘与分析,基于已报道的X射线晶体结构,确定了与钒形成六元螯合环的柔性配体的构象偏好。我们旨在通过此分析揭示配体构象对结构的影响,以开发更具效力的生物活性分子。所检测的配合物在其六元螯合环中包含NVN、OVN或OVO单元,总计约500个结构被汇编并依据其配位模式与构象进行分类。分析显示,椅式构象占主导(60%),其次为扭船式(17%)与船式(16%),半椅式仅占1%。这一分布与有机环己烷构象稳定性趋势一致,表明配体构象受基本物理有机化学原理支配。此外,螯合物组成(如NVN与OVO单元)显著影响构象偏好,进而可能影响配合物稳定性与生物活性(如抗癌、抗菌效能)。

Conclusion

本研究通过数据挖掘与分析,基于已报道的X射线晶体结构,确定了与钒形成六元螯合环的柔性配体的构象。我们最终旨在探究构象是否可影响配合物的生物活性。所检测的配合物在其六元螯合环中包含NVN、OVN、OVO、NVN(sp2)C(sp2)单元,总计约500个结构被依据其配位原子与构象汇编分析。

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