2024年玻利维亚奥罗普切病毒的基因组溯源与本地传播动态解析：揭示跨境传播与新型重配株的流行特征

本研究针对2024年玻利维亚奥罗普切病毒（OROV）暴发开展溯源研究，通过全基因组测序与系统地理学分析，揭示OROV新型重配株（OROVBR-2015–2024）从巴西西部亚马逊地区向玻利维亚的至少两次独立输入事件，并发现病毒在本地隐匿传播2–3个月后才被检测到。该研究强调了跨境区域病毒监测的紧迫性，为亚马逊流域虫媒病毒防控提供关键科学依据。

　　

在美洲热带地区，奥罗普切病毒（Oropouche virus, OROV）是一种由蠓虫（Culicoides paraensis）传播的虫媒病毒，可引起奥罗普切热，其症状与登革热、基孔肯雅热相似，早期难以区分。近年来，OROV疫情呈现显著上升趋势，2024年美洲地区确认病例超过1万例，其中巴西、秘鲁和玻利维亚疫情尤为严重。更令人担忧的是，以往被认为病情较轻的OROV感染，在2023–2025年流行期间首次报告了孕产妇-胎儿并发症和死亡病例，提示其致病性可能发生改变。尽管玻利维亚早在2005–2007年就曾通过血清学方法检测到OROV感染，但缺乏系统的分子流行病学监测，病毒输入来源、传播路径以及在本地建立传播链的潜力仍不清楚。

在此背景下，由Joel Alejandro Chuquimia Valdez、Ighor Arantes、Sebastián Sasías Martínez等来自玻利维亚热带病国家中心（CENETROP）及多个国际机构的研究人员合作，在《The Lancet Regional Health - Americas》发表了针对2024年玻利维亚OROV疫情的基因组特征与传播动态研究。该研究旨在阐明导致本次疫情的病毒来源、输入次数以及在国内的扩散路径。

研究团队运用了几项关键技术方法：首先，他们从2024年1月至5月期间玻利维亚三省（Pando, Beni, La Paz）收集的156例RT-qPCR阳性样本中，选取34例（基于Ct值<25、采样时间和地点）进行全基因组测序；采用基于扩增子的策略（amplicon-based approach）和Illumina测序平台完成高通量测序与基因组组装。其次，利用最大似然法（Maximum Likelihood, ML）和贝叶斯系统地理学分析（Bayesian phylogeographic analysis），分别构建了OROV三个基因组节段（L、M、S）以及拼接节段的系统发育树，并基于离散扩散模型重构病毒传播的时空动态。此外，研究还整合了流行病学数据和临床症状信息，进行统计分析。

研究结果部分主要包括以下内容：

一、流行病学数据：

研究显示，2024年玻利维亚共报告356例OROV确诊病例，首例病例于1月中旬在Pando省发现，4月中旬达到高峰。病例主要分布在La Paz省（75%），其次为Beni（21%）和Pando（3%）。常见症状包括发热（96.6%）、头痛（93.9%）和肌痛（83.0%），与以往疫情相比，关节痛和眶后疼痛发生率极低。

二、OROV在玻利维亚的时空传播模式：

基因组系统发育分析表明，所有玻利维亚病毒序列均属于新型重配株OROV_{BR-2015–2024}，特别是其下的AMACRO-II亚支。贝叶斯系统地理学分析进一步揭示，病毒至少两次从巴西Acre州首府Rio Branco输入至玻利维亚Beni省的Guayaramerín和Riberalta市，输入时间估计在2023年10月初至11月初。随后，病毒在玻利维亚国内进一步扩散，形成两个主要传播簇（BO-I和BO-II），传播至Pando省和La Paz省多个城市。从病毒输入到首次检测到病例，中间存在约2–3个月的隐匿传播期。

三、讨论与结论：

本研究首次证实，OROV新型重配株（OROV_{BR-2015–2024}）于2023年底多次从巴西跨境传入玻利维亚，并成功在当地建立传播链。疫情暴发与亚马逊雨林雨季相吻合，提示气候条件和媒介密度对病毒传播具有重要影响。尽管本次疫情以轻症为主，但国际范围内出现的严重病例和死亡报告警示我们必须加强OROV的监测与应对能力。

该研究的发现强调了跨境区域（如巴西Acre、Rond?nia州与玻利维亚Beni省之间）在病毒传播中的关键作用，尤其是Guayaramerín与巴西Guajará-Mirim之间频繁的贸易和人员流动可能促进了病毒输入。未来，需在亚马逊跨境地区建立更活跃的分子与病媒监测系统，以及早发现疫情并采取控制措施。

研究的局限性主要在于部分关键地区样本不足（如Rond?nia州的序列较少），可能影响传播路径推断的准确性。此外，玻利维亚国内一些病例高发城市（如La Asunta、Chulumani）未能获得病毒基因组，也限制了对传播网络的全面解析。

综上所述，这项研究不仅揭示了OROV在玻利维亚的传入与扩散机制，也为全球范围内新兴虫媒病毒的跨境监测与早期预警提供了重要范式。