益生菌调控腹泻中华穿山甲肠道菌群结构及功能恢复的16S rRNA测序研究

本研究通过16S rRNA测序技术揭示益生菌干预对腹泻中华穿山甲肠道菌群的重构作用，发现其可显著提升微生物多样性（α/β多样性分析），降低潜在致病菌（如Escherichia-Shigella, P=0.04），促进有益菌（Lactobacillus）增殖，为濒危物种肠道疾病提供微生态治疗新策略。

　　

Highlight

16S rRNA测序结果

从24份穿山甲粪便样本中共获得1,747,240条原始读数（873.61 M碱基），数据已保存于NCBI GenBank（BioProject编号PRJNA847400）。经质控过滤后，得到1,539,577条高质量标签。分类学注释鉴定出22个门、346个属和307个物种。恢复组（R组）与腹泻组（D组）的观测物种数分别为520.92±112.16和[数据未完整呈现]。

讨论

本研究基于16S rRNA扩增子测序的微生物组分析，揭示了12只腹泻中华穿山甲经益生菌治疗后肠道菌群的变化。结果表明，益生菌提升了穿山甲肠道菌群多样性，并促进了乳酸杆菌（Lactobacillus）等微生物群体的增殖，从而推动腹泻的康复。据我们所知，这是首项记录中华穿山甲康复过程中菌群动态变化的研究。

结论

综上所述，我们的结果表明恢复组的微生物多样性显著增强。益生菌治疗后，中华穿山甲的肠道菌群结构也发生显著改变。值得注意的是，潜在病原体的相对丰度下降；然而某些有益菌种的减少也被观察到，这一现象的机制需进一步研究。肠道菌群的这些组成变化似乎有助于腹泻康复。