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犬肝细胞癌(HCC)中miRNA转录组谱的失调鉴定及其与人类HCC的比较研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月22日 来源:Research in Veterinary Science 1.8
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本研究通过小RNA测序(NGS)和qRT-PCR技术,首次系统揭示了犬肝细胞癌(HCC)中29个差异表达miRNA(DEmiRNA)的转录组特征,并发现其与人类HCC存在高度保守性。研究通过KEGG通路分析证实这些miRNA参与p53信号通路、细胞周期调控和DNA损伤修复等关键致癌机制,为跨物种肿瘤模型构建和miRNA靶向治疗(如miR-182/183簇、miR-34a)提供了重要理论依据。
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临床样本与细胞培养
犬HCC组织样本(n=15)取自于鹿儿岛大学教学医院接受手术切除的犬只。经认证病理学家确诊的HCC组织用于本研究,患者主人均签署知情同意书。补充表1列出了HCC犬的详细信息。对照肝脏组织样本采集自 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd.(鹿儿岛)的9只无肿瘤比格犬。
犬HCC的小RNA谱分析
通过NGS技术对三例HCC和三例非肿瘤肝组织进行RNA测序读长分析,发现清洁读长的长度分布集中在20-24核苷酸区间(补充图1)。序列读长通过miRBase及Ensembl犬类/人类非编码RNA(ncRNA)数据库注释。对照组和HCC组织的注释读长占比分别为96%和92%,其中75%-85%为miRNA读长。
讨论
尽管小RNA研究取得进展,犬HCC的全转录组miRNA谱仍属未知。本研究系统分析了全小RNA转录组,揭示了多个差异表达miRNA。我们既往报道的miR-1/c-met失调与本研究结果一致,且新发现20个上调和8个下调miRNA。这些miRNA在人类HCC中多数呈现相似表达模式,提示其跨物种保守性。功能分析显示上调miRNA主要富集于p53通路(如miR-34a)和细胞周期调控,而下调miRNA(如miR-146a、miR-490)参与癌症通路和分化过程。本研究为基于miRNA的诊断和治疗策略提供了潜在靶点。
结论
本研究解析了犬HCC的miRNA谱,发现差异表达miRNA与人类HCC高度相似。上调的miR-182/183簇与miR-34a,以及下调的miR-146a、miR-490和miR-338,可作为治疗犬HCC的潜在候选分子。这些miRNA涉及多种癌症相关通路,其跨物种保守性凸显了比较肿瘤学研究的价值。
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