植物内质网相关降解机制调控PIN-LIKES蛋白条件性周转的新发现

【字体: 时间:2025年09月22日 来源:SCIENCE ADVANCES 12.5

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  本研究针对植物如何通过内质网相关降解(ERAD)机制动态调控PIN-LIKES(PILS)蛋白周转这一关键问题展开。研究人员通过蛋白质组学筛选、遗传学分析和药理学干预,首次揭示ERAD复合体组分HRD1A/B在非胁迫条件下介导功能性PILS蛋白的蛋白酶体依赖性降解。该发现阐明了内质网蛋白质稳态与植物生长调控的分子交叉,为理解植物适应内外源信号提供了新机制,对作物抗逆性调控具有重要启示意义。

  

在植物生长发育过程中,生长素(auxin)作为关键植物激素,通过其在不同细胞区室间的精确分布调控着植物对环境变化的适应性响应。虽然细胞间生长素运输机制已有较多研究,但细胞内生长素稳态的调控机制,尤其是内质网(Endoplasmic Reticulum, ER)层面上的调控,仍存在大量未知领域。PIN-LIKES(PILS)家族蛋白作为定位在内质网的生长素运输调控因子,通过限制生长素向细胞核的扩散,间接影响生长素信号传导。已有研究表明,PILS蛋白的丰度受到光照、温度、内质网应激以及多种植物激素的翻译后调控,然而这些调控背后的分子机器及其工作机制尚不明确。

为了揭示PILS蛋白的降解机制,研究人员在《SCIENCE ADVANCES》上发表的最新研究中,综合运用蛋白质组学、分子生物学、遗传学及药理学等方法,系统论证了内质网相关降解(ER-associated degradation, ERAD)机制在调控PILS蛋白周转中的核心作用。

研究主要依托以下关键技术:通过抗体亲和纯化结合质谱分析(co-IP/MS)筛选PILS蛋白的互作组;利用本氏烟(Nicotiana benthamiana)瞬时表达系统进行免疫共沉淀(Co-IP)验证蛋白互作;采用酵母双杂交(split-ubiquitin system)和比率型双分子荧光互补(rBiFC)技术验证蛋白间直接相互作用;通过药理学抑制剂如硼替佐米(Bortezomib, BTZ)靶向蛋白酶体、LS102抑制HRD1活性;并借助细胞生物学手段如共聚焦显微镜观察蛋白定位与动态变化。

RESULTS

研究发现,与经典质膜定位的PIN蛋白不同,PILS蛋白并不依赖布雷菲德菌素A(BFA)或VAC1敏感的囊泡运输途径进行降解。蛋白酶体抑制剂BTZ处理显著提高了PILS3、PILS5和PILS6的蛋白水平,表明其降解依赖于26S蛋白酶体功能。进一步的蛋白质组学筛选显示,PILS2/3/6与ERAD复合体的关键组分(包括HRD1A、HRD1B、PAWH1、PAWH2等)存在强烈相互作用。Co-IP、酵母双杂交和rBiFC实验一致证实PILS3可与HRD1B、DER2.1、DER2.2等发生直接互作。

为排除PILS过表达导致非特异性ERAD激活的可能性,研究者利用内质网滞留型突变体bri1-5作为报告系统,发现PILS6的过表达并不影响BRI1-5的降解,说明PILS与ERAD的互作具有特异性,并未干扰其经典的蛋白质质量控制功能。

遗传分析表明,hrd1a hrd1b双突变体在黑暗下胚轴生长中表现出明显缺陷,而pils3突变可部分回补该表型,说明HRD1通过调控PILS影响生长。表型分析、荧光定量及蛋白免疫印迹(Western blot)结果一致表明,在hrd1a hrd1b背景中PILS6-GFP的稳定性显著提高,蛋白周转速率下降。HRD1特异性抑制剂LS102处理可在数小时内快速提高PILS蛋白丰度,进一步确认HRD1在PILS降解中的直接作用。

研究还发现,EBS5/HRD3(ERAD调节亚基)的过表达可促进PILS5降解,并回补其过表达导致的表型,说明ERAD活性增强可加速PILS周转。此外, brassinolide(BL)和高温诱导的PILS6降解在hrd1a hrd1b突变体中显著受阻,表明ERAD参与多种信号条件下PILS的条件性降解。

尤为重要的是,低浓度脱落酸(ABA)可特异性诱导PILS3降解,而不影响其他PILS成员,该过程依赖于HRD1和蛋白酶体活性,且不引发内质网应激反应,说明ERAD可响应特定激素信号精确调控底物周转。

DISCUSSION

该研究不仅首次将PILS蛋白鉴定为植物ERAD的生理性底物(physiological clients),还揭示了HRD1依赖的ERAD通路在非胁迫条件下调控植物生长的新功能。这一发现拓展了对ERAD功能的传统认知,将其作用从蛋白质质量控制延伸至发育信号的动态整合。该机制使植物能通过调控内质网生长素运输蛋白的稳定性,快速调整生长素信号输出,从而适应内外环境变化。

研究还提出了ERAD底物识别与选择性的新科学问题:ERAD机制如何区分错误折叠蛋白与功能性底物?不同信号如何特异性调控特定PILS成员的降解?这些问题的解答将深化对植物内质网蛋白质稳态与信号交叉网络的理解。

综上所述,该项研究系统阐明了ERAD机制通过调控PILS蛋白周转影响植物生长及环境适应的分子 pathway,为作物抗逆育种和生长调控提供了新的靶点与思路。

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